一株深海热液来源PAHs降解菌TVG9-Ⅶ的鉴定及降解特性研究

摘要

目的：了解一株深海热液来源PAHs降解菌的分类地位、降解特性及其降解PAHs的分子机制。方法：通过16S rRNA基因的克隆测序，鉴定其分类地位；利用GC-MS测定其对PAHs的降解率；同时构建菌株基因组的Fosmid文库，克隆PAHs降解基因簇，随后利用RT-PCR和qPCR研究降解基因在PAHs诱导条件下的表达情况。结果：从西南太平洋劳盆地热液沉积物的PAHs富集菌群中，分离获得一株PAHs降解菌TVG9．Ⅶ，系统发育分析表明它与Novosphingobium indicum H25T菌株最近缘(99．7％)。该菌株在21d内对菲、荧蒽和芘的降解率分别为95．2％，57．3％和69．6％，对混合PAHs中菲、荧蒽和芘的降解率分别为64．7％，78．1％和74．5％，即混合PAHs中菲将有助于菌株对荧蒽和芘的降解。通过构建Fosmid文库，克隆了一个12．522kb包含PAHs降解起始双加氧酶(PheA1a/b)基因的基因簇；RT-PCR和qPCR实验表明，pheA1a 基因仅在菲的诱导下上调表达，而对萘及高环荧蒽和芘的诱导无响应。结论：菌株TVG9Ⅶ是Novosphingobium属深海热液来源的PAHs降解菌，具有良好的降解特性，特别是对高环PAHs的降解效果较好，其对高环PAHs降解的分子机制值得进一步研究。