猪细小病毒YL株的全基因序列克隆与分析

摘要

将猪细小病毒基因组分4个重叠片段进行PCR扩增,并将产物克隆到pGEM-T载体中,测定基因组近全长序列。其中编码猪细小病毒非结构蛋白基因(NSl基因)全长为2189 bp,编码662个氨基酸;编码结构蛋白基因(VP2基因)全长为1740 bp,编码579个氨基酸。序列分析结果表明,猪细小病毒YL株与与国内外主要毒株NSl基因核苷酸同源性为:97.8%-99.4%,氨基酸同源性为96.7%-99.5%,与国内外主要毒株VP2基因核苷酸98.7%-99.7%,氨基酸同源性为:97.4%-99.8%;PPVYL株的进化分析表明,PPVYL株与EU79064 1毒株处在同一小分支上,遗传距离最近。

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