鸡SelW克隆及其蛋白结构与功能预测

摘要

硒蛋白W(Selenoprotein W，SelW)是动物机体内重要的一个小分子硒蛋白，而禽类SelW的相关信息尚属空白。本文从饲喂富硒饲料鸡大脑组织中克隆荻得了全长为834bp的鸡SelW cDNA全序列(GenBank登录号GQ919055)，其包含5’-UTR、一个完整的ORF、3'-UTR、起始密码子为ATG、终止密码子为TGA，编码Sec的密码子TGA位于113-115位，3'-UTR中含SECIS元件和从AATAAA。鸡SelW蛋白由85个氨基酸组成，第10-13位含有-CXXU-基序，分子量为9.3217kDa，具有3个亲水区域，蛋白质空间结构中含有4股β折叠，2个外在的α螺旋，形成β1-α1-β2-β3-β4-α2的二级结构，其中β1与β2是平行的，与α1共同形成SelW蛋白家族共有的β1-α1-β2基序；预测其属于EC 1.11.1.9，可能具有GPx家族成员的功能，该蛋白第9-16、18，41-47、66位氨基酸残基可与DAAO结合，推测DAAO可能成为鸡SelW的靶点分子。