PRRSV-GP5基因的克隆及其蛋白结构和B细胞表位预测

摘要

本研究应用RT-PCR扩增PRRSV-GP5目的基因，将纯化DNA与pMD18-T栽体连接并转化入DH-5a菌株，将阳性重组质粒进行测序和同源性对比。以此基因为材料，应用同源模型化的方法建立其3D结构和DNAStar软件预测其二级结构、亲水性、抗原指数、表面可及性及柔韧性，并综合分析了其B细胞抗原表位。结果表明，PRRSV-GP5蛋白呈现较规则的空间结构，其肽段32-36、51-53、140-142、146-151和196-197可能是其优势B细胞抗原表位区域，该结果将为PRRSV-GP5基因工程疫苗的研究和体外表达产物的应用提供理论依据。