鸽源新城疫病毒陕西分离株P基因克隆与序列分析

摘要

目的：通过对鸽源新城疫病毒(Newcastle disease virus，NDV)陕西分离株(NDV/Pigeon/ShX/China/2003)P基因的克隆和序列分析，为研究P基因及V基因的功能奠定基础，也为防治新城疫(Newcastle disease，ND)提供科学依据。 方法：用非免疫鸡胚增值病毒，HA及HI试验鉴定增殖的病毒。参考GenBank发表的NDV基因序列设计1对特异性引物，RT-PCR扩增NDV/Pigeon/ShX/China/2003 P基因的全长片段，并进行克隆、序列测定和序列分析。 结果：NDV/Pigeon/ShX/China/2003 P基因的全长1 451 bp，其完整的ORF长度为I 188 bp，编码395个氨基酸。同源性比较可知：NDV/Pigeon/ShX/China/2003与其他分离株P基因核苷酸序列同源性在63.6％～92.9％之间，推导氨基酸序列同源性在67.7％～92.2％之间。系统发育进化树表明NDV/Pigeon/Shx/china，2003与P68亲缘关系最近，与F48E9和La Sota毒株处于进化树的不同分支。 结论：NDV/Pigeon/ShX/China/2003与国内外已报道的毒株间存在较大变异。