通过文献挖掘建立乳腺癌相关基因关联网络的研究

摘要

已有的生物学文献中蕴涵了大量的有用信息,通过文献挖掘对特定主题的文献进行分析,可以有效和有针对性的将这些信息提取出来并进行整合,学习出新的知识.本文通过统计以乳腺癌为主题的PubMed文献摘要中基因的出现频率,定义了一种表征基因相互关系的关联强度.基于关联强度对这些文献中所提及的基因聚类,构建各类的基因关联网络,使用MDS实现了网络的在低维空间中的可视化,并详细分析了部分试验结果.分析发现这些关联人有明确的生物意义,表明用文献挖掘技术和方法建立特定主题的基因关联网络是有效的和有意义的.