黑羽番鸭LPL基因多态性与肌肉中营养成分相关分析

摘要

本文以黑羽番鸭为素材，进行试验研究，在7对引物的检测结果中发现2对引物(暂命名为引物3、引物7)的扩增片段中存在多态。引物3扩增产物检测显示3种基因型，分别定义为EE,FF,EF，序列比较发现在第3内含子第4位点存在A-G突变。FF型基因型频率最高为0.3818 , EF型次之为0.3455 , EE型最低为0.27270F等位基因频率比E等位基因频率高0.1090。引物7扩增产物检测显示3种基因型，分别定义为HH,HI,II，序列比对发现在第3内含子第 120,128位分别存在G-A,A-G突变。HI型基因型频率最高为0.4122 , HH型次之为0.3030 , CC型最低为0.28480 H等位基因频率比I等位基因频率高0.0182。根据2对引物计算出群体平均纯合度为0.5031，杂合度为0.4969，多态性信息含量为0.3735，在引物3中，EE型公鸭胸肌中Ala含量显著性高于EF型,FF型;FF型母鸭胸肌中Asp,His显著性高于EF型。FF型公鸭腿肌中Ser, Pro含量显著高于EE型，3个基因型在其余营养物质间差异不显著;EF型母鸭腿肌中Cys ,Met含量显著高于FF型.EE型Lvs含量显著高于EF型，3个基因型在其余营养物质间差异不显著。LPL基因包括了10个外显子和9个内含子，序列比较长。人类LPL基因已经检测到110多个突变位点，突变种类繁多，主要包括了错义突变、无义突变、同义突变、缺失和插人等，其中以错义突变为主，与各种代谢异常的关系最为密切。本研究在2个位点发现了突变，黑羽番鸭的平均纯合度为0.5031，多态信息含量为0.3735，说明黑羽番鸭在乙尸乙基因位点上为中等多态。