棘腹蛙Japonicin-Pb抗菌肽的分离及表达谱分析

摘要

基于本实验室构建的棘腹蛙皮肤转录组数据库,利用RT-PCR从棘腹蛙皮肤组织中克隆Japonicin-pb前体序列,通过结构域比对的方法分析其结构.利用Real-time PCR检测3种Japonicin-pb在不同生长温度(15℃、18℃、21℃、24℃、27℃和30℃)及组织(血液、肌肉、肝脏和皮肤)的表达图谱.克隆到3种Japonicin-pb前体序列,结构域比对表明,3者拥有相同的N端信号肽和中间间隔区,长度分别为19、20和12个氨基酸残基的肽序列,命名为Japonicin-1apb,Japonicin-1bpb和Japonicin-3pb.Japonicin-1apb主要在皮肤组织中表达,且表达量随着生长温度的升高而逐渐增加;Japonicin-1bpb在不同组织或生长温度下的表达差异均不显著;Japonicin-3pb主要在肝脏中表达,对生长温度的响应不敏感.为棘腹蛙源3种Japonicin-pb后续功能研究以及开发应用提供了重要的序列及表达谱信息.