番鸭卵巢小RNA文库的构建及生物信息学分析

摘要

本研究以就巢期和产蛋期的番鸭为研究对象,利用NEB multiplex Small RNALibrary PrepSet for illumina构建样本cDNA文库,进而利用Hisque2500SE50高通量测序技术对番鸭产蛋组和就巢组文库进行上机测序,得到结果如下:通过Hisque2500SE50测序,成功获得了番鸭产蛋组和就巢组卵巢组织小分子RNA.产蛋期样本的原始小RNA序列和大于18nt小于30nt的高质量序列分别为7966848条,6824590条.就巢期样本的原始小RNA序列和大于18nt小于30nt高质量序列分别为9612842条,8242042条.就巢期样本和产蛋期样本在序列长度分布上显示了相同的趋势,序列长度分布图均在20-24nt存在一个高峰,22nt的小RNA序列处于峰顶.产蛋期样本中,20-24nt的小RNA占94.1％,就巢期样本中20-24nt的小RNA占91.1％.这表明就巢期样本和产蛋期样本在小RNA序列长度分布上略有差异,但总体趋势一致.为进一步探讨影响番鸭繁殖性能的分子调控机制奠定基础.