高羊茅光敏色素A基因FaPHYA的克隆与分析

摘要

以高羊茅转录组学测序获得的PHYA序列为模板,同时结合3’RACE和5’RACE方法从高羊茅中扩增出PHYA基因的全长cDNA序列,命名为FaPHYA.该序列cDNA全长3983bp,具有完整的开放阅读框(ORF,293～3682bp),编码蛋白为1129个氨基酸,FaPHYA的N端由GAF和Phytochrome结构域组成;C端包括2个重复的PAS结构域,1个组氨酸激酶A结构域,1个类似组氨酸激酶的ATP酶结构域.对编码蛋白氨基酸序列的同源性分析表明,FaPHYA与单子叶植物PHYA蛋白的氨基酸序列一致性较高,同源一致性水平达85％以上,亲缘关系较近.与双子叶植物的PHYA蛋白的氨基酸序列一致性较低,亲缘关系相对较远.