猪圆环病毒2型HB—MC1株全基因组序列测定与分析

摘要

参照发表的猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)全基因组序列,设计合成了一对特异性引物,对2014年从河北省满城县某发病猪场分离到的1株PCV2(命名为HB—MC1)的全基因组进行了序列测定.应用DNAStar序列分析软件,对所测序列与GenBank中登录的PCV2序列进行同源性比较,结果显示,HB—MC1柣的基因组全长为1767nt,其ORF1序列与GenBank登录的一些具有代表性的PCV2参考序列同源性高达97.2％～99.9％,其ORF2同源性在89.9％—99.6％.进化树分析结果显示,该毒株为PCV2α亚型,毒株部分核苷酸位点显示其属于强毒力毒株.研究结果揭示了HB—MC1株基因组特征与摹因亚型,丰富了PCV2的基因组信息数据.