动植物复杂性状关联分析及其应用

摘要

随着现代测序技术的逐渐成熟，人类和动植物的许多物种正在相继开展全基因组测序，并产生了遗传群体的SNP和转录组的海量基因型数据。全基因组关联分析(GWAS)方法不需要构建连锁图，可直接分析遗传群体基因型和表现型变异的关联，从而检测候选基因，已被广泛地应用于人类和动植物的基因定位。但是目前的方法尚不能有效地解析复杂性状的基因间上位性效应及基因与环境/处理的互作效应。发展了新的GWAS分析方法，可用于分析动植物任意群体的全基因组SNP:和转录组变异与复杂性状表现型的关联，从而检测控制表现型变异的数量性状SNP(Quantitative丁raft SNP,QTS)和数量性状转录座(Qua ntitativeTrait Transcript, QTS)，估算基因上位性效应及环境互作效应。在对动植物遗传群体基因效应分析的基础上，可提出直接对关键SNPs和基因转录水平进行选择的分子育种策略。