CYP86MF同源基因的克隆及特征分析

摘要

本文通过用保守的特异引物进行PCR扩增,并结合RACE技术,从大白菜品种黄芽14,萝卜品种'圆白'和诸葛菜三个材料中扩增到三个完整的cDNA全长,分别命名为BCCYP86MF,RSCYP86MF和OVCYP86MF.这三个基因cDNA全长分别为1854bp,1818bp,1876bp,分别编码524,526,534个氨基酸.将所推导的氨基酸序列与从数据库中得到的已知基因进行排序,发现它们与拟南芥CYP86家族所有成员的氨基酸相似性都大于38﹪,将它们均归为细胞色素CYP86基因家族.BCCYP86MF和RSCYP86MF与CYP86C4亚家族氨基酸同源性均大于55﹪,因此归为CYP86C4亚家族,而OVCYP86MF与CYP86C3的同源性最高,为86.5﹪,归为CYP86C3亚家族.根据氨基酸序列的排序结果绘制的系统树表明CYP450基因的氨基酸序列进化与植物进化基本保持一致,这三个基因与拟南芥5个基因的亲缘关系比与水稻、小麦的要近.对其蛋白二级结构预测结果发现它们都具有FxxGxRxCxG这个细胞色素P450典型的保守结构域,而且其氨基酸组成也很相似.