宠物鸟H3N8亚型流感病毒HA基因的特征性分析

摘要

本研究对来自香港和世界各地的10株庞物鸟H3N8流感病毒的HA基因进行了全基因序列测定,用DNASTAR和Tree View软件进行序列编辑,序列翻译,进化树绘制和分子演化分析.结果表明来自不同国家和地区的H3N8流感病毒的HA基因都非常相似,都形成一个独立的分支,属于欧亚亚系,同源率为95.9-100﹪;香港2001年庞物鸟的毒株之间的同源率最高,分别为99.2-100﹪.HA基因与A/Equine/Jilin/89(H3N8)的同源性为最高,在92.9-93.6﹪之间.氨基酸分析表明只有A/Parakeet/Netherlang/33/01的HA基因在97-99受体结合位点处有一个额外潜在的糖基化位点NKT;因此可见宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因高度保守,HA基因均来自共同的祖先.