2005-2006人源H3N2亚型猪流感中国分离株分子演化的研究

摘要

本研究对黑龙江和广东省的四株H3N2亚型猪流感分离株进行了全基因组测序,主要对HA和NA基因进行了序列分析,并绘制了进化树.序列分析结果表明:SW/GD/164/06、SW/GD/165/06和SW/GD/166/06三株病毒的序列有较高的同源性,HA基因核苷酸和氨基酸序列的同源性达99.6～99.9 ％,NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性达99.4～99.7 ％;三株病毒的HA和NA基因分别与参考毒株中SW/GD/1/03和HM/HK/11433/99同源性最高;SW/HLJ/01/05的HA和NA基因则与参考毒SW/HLJ/74/00和HM/BJ/39/75同源性最高.经进化树分析可见,四株病毒皆属于人源H3N2亚型猪流感.