A群猪轮状病毒JS株vp7基因序列分析

摘要

根据已发表的猪轮状病毒OSU毒株vp7基因核苷酸序列ORF两端保守区序列，设计一对特异引物，以猪轮状病毒JS毒株反转录cDNA为模板，通过PCR方法扩增出长约1000bp目的片段。将其进行T-A克隆、序列测定和分析。结果表明，vp7基因全长1062bp，含有1个981bp的开放阅读框，编码326个氨基酸。与已知的15个毒株vp7全长基因的核苷酸及推导的氨基酸序列比较，同源性分别为74.5%～78.5%和75.2%～83.1%，核苷酸系统发育进化树结果表明，JS毒株与轮状病毒G9型参考毒株ICB2185、O-1亲缘关系较近，分为1个群，表明JS毒株血清型为G9型。目前，我国尚未见猪及其它动物轮状病毒G9型流行株的报道。