A群猪轮状病毒JS株vp6基因序列分析

摘要

参考GenBank中发表PRV OSU毒株VP6序列ORF两端保守区，设计1对特异引物，以PRV JS株反转录cDNA为模板，通过PCR方法获得约113kb的基因片段，并克隆到pMD18-T载体中进行序列测定。测序结果表明：获得了vp6的1320bp全基因序列；将其ORF与国内外9株PRV vp6基因的ORF进行核苷酸和氨基酸同源性比较，核苷酸同源性在77.11%～91.11%之间,氨基酸的同源性在89.17%～99.15%之间；在氨基酸系统发育进化树中，JS毒株与A131、OSU、CN86毒株亲缘关系较近，为一个进化群。