高致病性蓝耳病病毒广东分离株ORF7基因的序列分析

摘要

从广东各发病猪场病料中分离到12株高致病性PRRSV，分别命名为GDB1～GDB12。设计一对ORF7基因的特异性引物，应用RT-PCR方法从各PRRSV病毒株中扩增出ORF7基因片段，将其分别克隆到pMD19-T载体上，通过测序分析获得正确的序列。结果表明，12株PRRSVORF7基因长度为489bp，共编码124个氨基酸。用DNAStar软件对序列进行分析，同时与经典毒株VR-2332株、LV株、JXA1及周边国家、国内分离株进行核苷酸序列同源性比较，并绘制系统进化树。结果显示GDB1～GDB12与美洲型代表株VR-2332核苷酸序列同源性在92.2%～93.3%之间，推导氨基酸序列同源性在92.2%～93.5%之间；和欧洲型代表株LV相比，核苷酸序列同源性在55.3%～57.4%之间，推导氨基酸序列同源性在55.0%～58.1%之间。与最近国内江西、湖南、湖北等地分离的PRRSV相比，核苷酸序列同源性在98.7%～100%之间，推导氨基酸序列同源性在98.0%～100%之间。从遗传进化树上可看出，12个毒株与Henan-1、SY0608、HUN4、NX06等毒株亲缘关系较近，与CH-1a、MLVResp、VR2332等毒株亲缘关系较远。