两核苷酸同时合成DNA测序方法的解码模型研究

摘要

两核苷酸同时合成DNA测序方法(sequencing by dinucleotide-synthesis,SBDS)是一种全新的测序方法,其原理与传统二代测序技术有很大不同.本文针对SBDS独特的测序原理,建立具有容错特性的解码算法,实现了对测序数据的解码.首先,在无测序错误情况下建立解码模型,根据两组编码序列(两轮测序结果)即可解码出真实序列.然后通过模拟真实测序环境(即引入测序误差),使用三组编码序列(三轮测序结果)获取真实序列的解,解码准确率可以达到90％以上.