11株猪繁殖与呼吸综合症病毒ORF5基因序列分析

摘要

从广东省不同地区呼吸道症状明显的组织样品中分离到11株引起MARC-145细胞病变的病毒,经RT-PCR和序列分析鉴定为美洲型猪繁殖与呼吸综合症病毒(PRRSV),其ORF5全基因均为603bp,不存在核苷酸的插入或缺失,但存在多个位点的点突变,推导的氨基酸序列相似性在97.0%-99.5%,与国内外参考株推导的氨基酸序列的相似性在85.1%-99.0%,11个毒株处于同一个大分支下,又分属不同的小分支,与XH-GD、JXA1等遗传距离较近,与YN01、CC-1、MLV、VR-2332的遗传距离较远,与HL的遗传距离最远。11个毒株ORF5氨基酸序列在两端的高变区和中间的较保守区均有不同程度的突变,均存在位置和序列均一致的4个潜在糖基化位点;抗原表位分析结果显示,在不同的表位分别有不同位点的点突变,但这些位点的突变,可能不会改变该区域的疏水性能,不会引起抗原表位的变化。