2003～2008年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株分子流行病学调查

摘要

GP5是猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)变异最大的结构蛋白，能够诱导机体产生中和抗体。2003-2008年从广西各县市采集PRRSV阳性病料，扩增得到的49株PRRSV ORF5基因序列，并对序列进行比较和分析。49个毒株的ORF5分别属于美洲型的Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ亚群，推导氨基酸分析发现：在中和表位区域GXLZ-1、GXIZ-2由H38→N3B、L39→I39，Ⅱ亚群所有毒株序列由L39→I39;在R13和R151毒力相关位点，GXGG-1变为Q13，GXLZ-1和GXLZ-2变为K151，其他毒株未发生突变。推测Ⅱ亚群广西毒株的毒力比Ⅰ、Ⅳ亚群的强;从2003～2005年和2006～2008年这2个时间段分析，在9aa、16aa、54aa、59aa、94aa、104aa、185aa出现了时间性的基因变异;遗传进化树分析发现，随着时间的推移，获得的广西毒株与CH-1a、MLV株亲缘关系逐渐发生偏离，2006年6月之后所获得毒株亲缘关系很近。相互之间同源性很高，且与国内PRRSV变异毒株JXA1高度同源，推断2006年后获得的毒株与变异株可能由同一毒株演化而来。