生脉散血中移行成分分子靶标的计算机系统生物学预测

摘要

目的：应用计算机系统生物学方法预测生脉散的分子靶标，并阐明有效成分群的协同作用机制。方法：采用TCMGeneDIT数据库系统，文本挖掘人参、麦冬、五味子各自所能影响的基因或蛋白质数据；收集生脉散中五味子醇甲、五味子醇乙、戈米辛D、五味子乙素、γ-五味子素、20(S)-人参皂苷Rh、人参皂苷Rk3等13种血中移行成分，并完成分子构建，且上载至服务器进行靶标预测；从BIND、BioGBID、DIP、HPRD、IntAct、MINT等分子相互作用数据库中收集与预测靶标有直接相互作用的蛋白质，进行综合分析。结果：已有的实验发现五味子有9个血中移行成分，人参只有4个血中移行成分；人参与55个基因相关，五味子与1个基因相关，没有基因与麦冬相关。人参的4种血中移行成分不但可直接作用于实验证实的靶标，还能影响相关靶标发挥广泛的生物学效应。五味子的9种血中移行成分只能通过影响相关靶标而发挥间接的治疗作用。结论：本研究结果可为生脉散的后续研究提供有用的线索，促进生脉散的分子作用机制研究，本研究策略可为中药复方的系统研究提供参考。