菌群结构

摘要： 目的:研究不同水源养殖的日本医蛭Hirudonipponica Whitman肌肉、肠道组织样本的细菌群落结构,分析除氯自来水养殖的可行性及日本医蛭相关的重要有益微生物。方法:分别在地下水和除氯自来水的循环养殖系统中进行日本医蛭养殖,采用PacBio三代高通量测序技术对不同水源养殖水蛭的肌肉和肠道组织样品进行菌种初步分类鉴定及微生物群落组成分析。结果:与地下水养殖的水蛭相比,除氯自来水养殖的水蛭样本表现出更简单的微生物群落结构,且黏液菌属(Mucinivorans)、梭杆菌属(Fusobacterium)、拟杆菌属(Bacteroides)等有潜在致病风险的菌属相对丰度明显低于地下水养殖组。结论:采用除氯自来水开展水蛭养殖工作是可行的。与日本医蛭相关的共生菌(Aeromonas和Rikenella)及有益微生物在水蛭的生长发育过程中起着重要的作用,提示可以利用环境或饵料中的有益微生物来提高日本医蛭的产量。

摘要： 为探究酱香型白酒大曲曲皮和曲心细菌群落结构的差异,采用Illumina Hiseq高通量测序技术对某酱香型白酒大曲曲皮和曲心两个部位的细菌群落多样性及菌群结构进行研究。结果表明,曲皮样品中细菌群落的多样性高于曲心样品,但其物种丰富度低于曲心样品。曲皮和曲心样品中的细菌菌群归属于7个门、13个纲、19个目、29个科和55个属,共有优势细菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria),曲皮样品的特有优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria);共有优势细菌属为枝芽孢杆菌属(Virgibacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、芽孢链菌属(Desmospora)、乳杆菌属(Lactobacillus)、糖多孢菌属(Saccharopolyspora),除Desmospora外,其他优势细菌属在曲皮和曲心中的含量差异较大。曲皮样品的特有优势细菌属为链霉菌属(Streptomyces)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingo-monas)、片球菌属(Pediococcus);曲心样品的特有优势细菌属为火山渣芽孢杆菌属(Scopulibacillus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)。

摘要： 为明确不同有机物浓度(50~150mg/L)和竹炭同时存在下厌氧氨氧化颗粒污泥系统的脱氮除碳功能菌群结构及代谢途径差异,采用宏基因组测序技术对其微生物分布规律和碳氮代谢基因表达进行了研究.结果表明,当COD浓度为50,150mg/L,添加竹炭显著提升了厌氧氨氧化菌(AnAOB)的相对丰度,Candidatus_Kuenenia的相对丰度分别由2.0%和2.9%增加至1.8%和4.5%.与只添加有机物的对照组相比,添加竹炭的处理组显著改变了微生物群落结构,在炭存在下异化硝酸盐还原为铵(DNRA)细菌丰度下降,反硝化菌属和碳代谢相关菌属丰度增加,说明竹炭的投加有助于维持厌氧氨氧化、反硝化和DNRA3个氮代谢途径群落结构的稳定.微生物共现网络分析表明,不同脱氮菌群的协同作用提高了总氮(TN)的去除率,竹炭可以通过Halomonas的富集提高Candidatus_Brocadia和Candidatus_Jettenia的抗逆性.通过KEGG数据库注释表明,有机物存在条件下竹炭提升了厌氧氨氧化颗粒污泥系统的碳氮代谢效能,尤其促进了糖酵解途径(EMP)与三羧酸循环(TCA cycle)的衔接.

摘要： [目的]本试验旨在研究低蛋白日粮添加不同水平尿素对育肥湖羊瘤胃发酵及微生物菌群结构的影响。[方法]70只育肥公湖羊(23.6~26.0 kg)随机分为5组,分别饲喂以下日粮:正常豆粕(SBM,170 g·kg^(-1)),低豆粕(40 g·kg^(-1))基础上添加0、10、20和30 g·kg^(-1)尿素(U0、U10、U20、U30)。试验预饲期1周,正试期8周。采集瘤胃液测定发酵参数和功能菌群数量,同时扩增细菌16S rRNA基因V3—V4区进行Illumina-MiSeq测序。[结果]与U10组相比,U20和U30组瘤胃液pH值显著升高(P0.05)。U10组Bacteroidetes的丰度显著高于SBM、U20和U30组(P<0.05),但Firmicutes却显著降低(P<0.05)。各组的主要优势菌属为Prevotella 1、Muribaculaceae norank、Rikenellaceae RC9 gut group和Christensenellaceae R-7 group。U10组Prevotella 1的丰度显著高于U20和U30组(P<0.05),而Rikenellaceae RC9 gut group、Christensenellaceae R-7 group和Ruminococcaceae NK4A214 group显著低于U30组(P<0.05)。RDA结果显示pH值、NH_(3)-N和总挥发性脂肪酸(TVFA)对瘤胃不同菌属的影响程度存在差异,其中pH值的影响最显著(P<0.05)。[结论]在低蛋白日粮中添加适量尿素(10 g·kg^(-1))可增加育肥湖羊瘤胃功能菌群数量,促进相关代谢产物的产生与利用,但日粮氮不足或尿素添加水平过高则会降低瘤胃功能菌群数量和改变细菌群落组成。

摘要： 为研究乳酸菌发酵剂对风干肠成熟过程中微生物数量、微生物多样性及感官品质的影响,分别将SHI-59(木糖葡萄球菌+戊糖片球菌+植物乳杆菌)、WBL-45(木糖葡萄球菌+肉葡萄球菌+清酒乳杆菌)、PRO-MIX5(木糖葡萄球菌+清酒乳杆菌+类植物乳杆菌)复合型商业发酵剂接种到肉馅中,经过12 d的成熟过程生产发酵型风干肠,3个接种组分别用SHI、WBL、PRO表示,以不接种作为对照组(control check,CK)。分别在成熟0、3、6、9、12 d取样,测定乳酸菌数、菌落总数、肠杆菌科数、假单胞菌数和葡萄球菌数变化,对成熟6、12 d的样品进行16S rDNA高通量测序分析,并对风干肠成品(成熟12 d)进行感官评定。结果表明:随着成熟过程的进行,样品乳酸菌数、菌落总数、肠杆菌科数、假单胞菌数和葡萄球菌数整体呈先升高后降低的变化趋势,SHI、WBL组的乳酸菌在肉馅中能够快速生长繁殖,WBL组能显著降低风干肠的菌落总数、肠杆菌科数和假单胞菌数(P<0.05),有利于提高风干肠的安全品质;SHI、WBL、PRO组风干肠的葡萄球菌数均显著高于CK组(P<0.05),这对风干肠的发色和风味的形成有积极影响;微生物多样性分析发现,风干肠在门水平主要有厚壁菌门、变形菌门和放线菌门,其中厚壁菌门为4组风干肠的优势菌门,在WBL组中相对丰度最高,3个接种组中乳杆菌属和漫游球菌属相对丰度大于CK组;质构特性分析和感官评定结果表明,乳酸菌发酵剂和复配发酵牛骨调味基料复合抗氧化剂协同作用能提高风干肠的感官品质,WBL组具有风干肠特有的风味,感官品质好。

摘要： 本试验旨在探究橙皮苷和迷迭香酸组合对脂多糖(LPS)攻毒大鼠回肠形态、菌群结构以及炎症反应的影响。将32只21日龄的无特定病原体(SPF)级SD大鼠随机分为4组,分别为LPS组、Hes组、RA组、Hes×RA组,每组4个重复,每个重复2只大鼠(公母各占1/2)。各组大鼠均饲喂标准基础饲粮,Hes组大鼠每日灌胃300 mg/kg BW的橙皮苷,RA组大鼠每日灌胃20 mg/kg BW的迷迭香酸,Hes×RA组每日灌胃150 mg/kg BW橙皮苷+10 mg/kg BW迷迭香酸,LPS组每日灌胃等量的生理盐水。灌胃处理共进行14 d,在第13天,所有大鼠腹腔注射剂量为500μg/kg BW的LPS溶液,用于诱导急性肠道损伤模型。结果显示:与LPS组相比,Hes×RA组大鼠回肠绒毛高度和绒隐比显著提高(P0.05);Hes×RA组大鼠回肠食糜中乳杆菌属(Lactobacillus)的相对丰度显著提高(P<0.05),放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、棒状杆菌属(Corynebacterium)和链球菌属(Streptococcus)的相对丰度显著降低(P<0.05);Hes×RA组大鼠回肠食糜微生物代谢产物乙酸、丙酸和总短链脂肪酸的含量显著升高(P<0.05)。与LPS组相比,Hes×RA组大鼠回肠黏膜中髓过氧化物酶(MPO)活性以及白细胞介素-6(IL-6)含量显著降低(P<0.05),白细胞介素-10(IL-10)含量显著提高(P<0.05)。与LPS组相比,Hes×RA组大鼠回肠黏膜中封闭蛋白-1(Claudin-1)和闭锁蛋白(Occludin)的mRNA相对表达量显著提高(P<0.05),闭锁小带蛋白-1(ZO-1)的mRNA相对表达量有增加的趋势(P=0.064)。与LPS组相比,Hes×RA组大鼠回肠黏膜中白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)和肿瘤坏死因子受体相关蛋白6(TRAF6)的mRNA相对表达量显著降低(P<0.05)。综上可知,橙皮苷和迷迭香酸组合可以改善LPS攻毒引起的大鼠回肠形态损伤,通过调节菌群结构、降低炎症反应来提高大鼠肠道健康状况。

摘要： 研究了单质硫颗粒自养反硝化柱中表面和间隙生物膜的微生物群落结构、功能基因和代谢途径等生物信息学特征.结果表明,硫颗粒表面生物膜的微生物菌群多样性低于间隙生物膜.氮代谢功能基因丰度差异较为显著,间隙生物膜中硝酸盐和亚硝酸盐的胞外转运蛋白基因丰度远高于表面生物膜,分别为0.0792%、0.109%与0.0157%、0.0314%.对于还原性反硝化代谢,表面生物膜的总基因丰度却明显低于间隙生物膜,分别为0.367%、0.406%.此外,参与反硝化过程的基因丰度明显不同,特别是将NO_(3)^(-)还原成NO_(2)^(-)以及将N_(2)O还原成N_(2)过程中的基因.对于硫代谢,没有观察到明显的差异.APS(硫酸腺苷)氧化是将SO_(3)^(2-)氧化为SO_(4)^(2-)的主要途径,其基因丰度远远高于直接氧化途径,分别为0.137%与0.0005%(表面)、0.138%与0.0007%(间隙).结果表明,在单质硫自养反硝化过程中,间隙生物膜与表面生物膜中的微生物存在合作关系,协同促进硫自养反硝化脱氮过程.

摘要： [目的]本试验旨在探究百里香酚和迷迭香酸组合对脂多糖(LPS)攻毒大鼠盲肠的屏障功能、菌群结构及炎症反应的影响。[方法]试验选取40只21日龄SD大鼠在适应性饲养7 d后,随机分为5组:空白对照组(Con)、攻毒对照组(LPS)、百里香酚组(Thy)、迷迭香酸组(RosA)、百里香酚×迷迭香酸组(Thy×RosA)。Thy组、RosA组和Thy×RosA组每天分别按照20 mg·kg^(-1)Thy、RosA、Thy×RosA(1∶1)的剂量灌胃大鼠,Con组和LPS组每天灌胃等量生理盐水。正式试验期共14 d。在正式试验第13天,除Con组外,对LPS组、Thy组、RosA组和Thy×RosA组大鼠腹腔注射500μg·kg^(-1)的LPS溶液建立急性肠道炎症模型。在正式试验第14天,将4组大鼠处死,采集盲肠组织,观察肠道形态;采集盲肠黏膜,测定IL-1β、IL-6、IL-10、TNF-α、二胺氧化酶活性、D-乳酸含量和ZO-1、Claudin-1、Occludin基因的mRNA相对表达量,采集盲肠食糜,测定盲肠菌群组成和短链脂肪酸的浓度。[结果]与Con组相比,LPS攻毒降低了盲肠D-乳酸含量,提高IL-1β水平;与LPS组相比,百里香酚和迷迭香酸组合提高了厚壁菌门的相对丰度,降低拟杆菌门的相对丰度,且提高了乳酸杆菌、Romboutsia、Turicibacter和致狭窄梭状芽孢杆菌1菌属的相对丰度,降低了未定义的鼠杆菌科、未分类的毛螺菌科、罗斯氏菌属、Alistipes菌属的相对丰度;与LPS组相比,百里香酚和迷迭香酸组合提高了乙酸、丙酸、丁酸和总短链脂肪酸浓度;与LPS组相比,百里香酚和迷迭香酸组合提高了ZO-1、Occludin、Claudin-1基因mRNA表达量和IL-10水平,降低了D-乳酸含量、二胺氧化酶活性、IL-6和TNF-α水平。[结论]百里香酚和迷迭香酸组合改善了盲肠菌群结构,提高了短链脂肪酸的浓度,增强肠道屏障功能,从而缓解肠道炎症,促进盲肠健康。

摘要： 目的通过鸟枪法宏基因组测序技术分析2型糖尿病伴牙周炎患者龈下菌斑中的菌群结构及功能。方法选择2例2型糖尿病伴牙周炎患者、2例2型糖尿病不伴牙周炎患者、3例单纯牙周炎患者及3例健康志愿者,均采集龈下菌斑,提取龈下菌斑基因组DNA并进行鸟枪法宏基因组测序,分析龈下菌斑的菌群结构及功能。结果2型糖尿病伴牙周炎患者龈下菌斑中丰度最高的菌种为齿垢密螺旋体、牙龈卟啉单胞菌、中间密螺旋体、福赛坦氏菌、文氏密螺旋体,单纯牙周炎患者龈下菌斑中丰度最高的菌种为牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体、福赛坦氏菌、索氏密螺旋体、中间密螺旋体,同时与2型糖尿病不伴牙周炎患者、健康志愿者比较,2型糖尿病伴牙周炎患者、单纯牙周炎患者龈下菌斑中的红色复合体丰度高(P均<0.05)。2型糖尿病伴牙周炎患者、2型糖尿病不伴牙周炎患者、单纯牙周炎患者及健康志愿者龈下菌斑中菌群基因组丰度差异明显基因有41个,其中2型糖尿病伴牙周炎患者的菌群功能基因表达主要集中在双组分调节系统、碳代谢及ABC转运系统通路中。结论2型糖尿病伴牙周炎患者龈下菌斑的菌群结构与单纯牙周炎患者相似,两者的差异可能主要集中菌群功能方面。

摘要： 【目的】探讨复合微生态制剂在断奶仔猪饲料中的添加比例及其替代抗生素后对仔猪的影响。【方法】选取80头日龄(28 d±2 d)、体重(9.31 kg±0.52 kg)接近,健康状况良好的三元杂交断奶仔猪(杜×长×大),随机分为5组,每组4个重复,每个重复4头仔猪(公母各半)。对照组饲喂基础饲粮;低、中、高剂量复合微生态制剂组(LOW、MED和HIG)分别在基础饲粮中添加0.1%、0.2%、0.3%复合微生态制剂(活菌数分别为1×1011、2×1011、3×1011 CFU/kg);抗生素组(ANT)在基础饲粮中添加75 mg/kg金霉素。试验期为28 d。记录试验仔猪初始体重、终末体重、腹泻及采食情况。试验第28天采集仔猪前腔静脉血,测定血清生化指标和免疫指标;采集盲肠内容物,利用16S rRNA测序技术分析肠道菌群变化。【结果】与对照组相比,①MED组的平均日增重(ADG)和平均日采食量(ADFI)均显著上升(P0.05);MED和HIG组的料重比(F/G)均显著降低(P0.05);LOW和MED组的腹泻率均显著降低(P0.05)。②MED和HIG组仔猪胸腺指数及MED组脾脏指数均显著上升(P0.05)。⑤LOW、MED和ANT组仔猪盲肠菌群厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度显著升高(P<0.05),LOW和ANT组普雷沃氏菌属_1(Prevotella_1)相对丰度显著下降(P<0.05);HIG和ANT组变形菌门(Proteobacteria)相对丰度显著下降(P<0.05);LOW、MED、HIG和ANT组理研菌科(Rikenellaceae)和弯曲杆菌属(Campylobacter)相对丰度显著下降(P<0.05),而乳杆菌科(Lactobacillaceae)、乳杆菌属(Lactobacillus)相对丰度显著上升(P<0.05);HIG组拟普雷沃菌属(Alloprevotella)相对丰度显著上升(P<0.05);MED、HIG和ANT组毛螺菌属(Lachnospira)相对丰度显著下降(P<0.05);LOW、HIG和ANT组粪杆菌属(Faecalibacterium)相对丰度显著上升(P<0.05)。相较于对照组和抗生素组,LOW和HIG组假单胞菌科(Pseudomonadaceae)相对丰度显著下降(P<0.05),LOW组瘤胃菌科(Ruminococcaceae)相对丰度显著上升(P<0.05)。【结论】饲粮中添加复合微生态制剂能够改善断奶仔猪的生长性能和免疫机能,改善盲肠微生物的菌群丰度,降低肠道致病菌的丰度,降低腹泻率,其中添加0.2%复合微生态制剂(活菌数为2×1011 CFU/kg)的效果较好,能达到与添加抗生素相似的饲喂效果。

摘要： 目的：揭示凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)糠虾期健康和发病育苗池水体菌群结构差异. 方法：从健康和发病育苗池各采集3份水样,提取水样基因组DNA,利用Illumina MiSeq测序技术对其进行16S高通量测序,分析菌群结构组成与多样性,并筛选指示健康状态的水体菌群. 结果：健康苗池水体菌群多样性和均匀度均显著高于发病苗池(P＜0.05).健康苗池中放线菌门(Actinobacteria)及其微杆菌科(Microbacteriaceae)、拟杆菌门(Bacteroidetes)及其圆杆菌科(Cyclobacteriaceae)和黄杆菌科(Flavobacteriacea)、β变形菌纲(β-Proteobacteria)及其丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、庞微菌门(Verrucomicrobia)及其分类未定科(OTU9),均优势存在,且序列丰度显著高于发病池(P＜0.01);相反,发病池中α-变形菌纲(α-Proteobacteria)及其红杆菌科(Rhodobacteraceae)和Stappia_f科、γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)及其交替单胞菌科(Alteromonadaceae)丰度均显著高于健康池(P＜0.01).属水平上,发病池红杆菌科4个分类未定属(OTU1、OTU6、OTU64、OTU123)、亚硫酸杆菌属(Sulfitobacter),以及交替单胞菌科交替单胞菌属(Alteromonas)丰度均显著高于健康池,而微杆菌科Limnoluna与Rhodoluna属和红杆菌科一个分类未定属(OTU4)丰度均显著低于健康池(P＜0.01). 结论：健康和发病糠虾期育苗池水体菌群结构和多样性存在显著差异,属水平上丰度差异显著的优势菌群可作为苗池健康状态指示菌群.

摘要： 本实验研究在净化甲醛废气的生物膜填料塔中分离纯化出三株能够降解甲醛的菌株,经16SrDNA序列在NCBI数据库进行BLAST比对,并选用L9(34)正交实验按菌株接种比例,对这三种菌群在驯化期间各填料塔内结构变化进行研究.结果表明:菌株C1属于恶臭假单胞菌(PseudomonasPutida),菌株C2属于巨大芽抱杆菌(Bacilussp.),菌株C3属于枯草芽抱杆菌(Bacilussubtilis);经填料塔内一段时间的甲醛废气驯化培养后,各个填料塔中菌群结构比例由初始接种比例逐渐变得统一,各菌群结构比例均大致为C1:C2:C3＝10:8:7.

摘要： 蜜蜂是重要的农业传粉昆虫,对全球农业及生态维护有着不可替代的作用.然而近年来美国、欧洲等地出现蜂群大量消失的迹象,给农业经济带来严重威胁.近年来人们逐渐发现蜂肠道微生物与维持宿主健康之间存在着联系,蜜蜂属(Apis)和熊蜂属(Bombus)个体都带有简单、特异的肠道菌群,并且蜂肠道菌群与人类等其他动物具有诸多相似之处,例如其通过社会性接触稳定传播的特性.本综述介绍了近年来通过体外培养、高通量测序等技术对蜂肠道微生物与宿主关系的研究,特别是其简化的菌群结构、宿主特异性,及其对蜜蜂食物消化、营养供给、病虫抵抗等方面的作用,并探讨了未来基于中国特有蜂种研究的方向,及蜜蜂作为优良的社会性动物模式体系对未来人类营养健康研究的可行性.

摘要： 以1日龄岭南黄肉鸡(♂)为试验动物,研究在日粮中长期添加亚剂量硫酸新霉素对黄羽肉鸡回肠黏膜菌群动态变化与组成的影响.于第1、7、14、21、28、35及42日龄分别从A组(饲喂基础日粮)和D组(饲喂基础日粮+50ppm硫酸新霉素)采集鸡回肠肠段并提取黏膜细菌基因组DNA,采用PCR-DGGE技术分析鸡回肠黏膜菌群结构,同时应用16S rDNA基因序列技术,建立42日龄鸡回肠黏膜细菌16S rDNA的随机克隆文库.DGGE图谱分析发现,A、D两组1～28日龄回肠黏膜细菌结构存在明显差异,其相似性为40％～60％;A、D两组肉鸡1～35日龄菌群结构发生变化的程度不同,A组的动态变化值(％change)为9％～33％,D组的动态变化值为17～45％.回肠文库分析发现,A组文库有94个序列,共产生9个OTUs(Operational Taxonomic Units),其中未知菌属(微杆菌属)所占克隆总数比例最大为48.94％(46/94),其次是乳杆菌属占38.30％(36/94);D组文库有93个序列,共产生6个OTUs,其中乳杆菌属所占克隆总数比例最大为49.46％(46/93),其次是微杆菌属占45.16％(42/93);两组回肠文库中其它菌属的组成种类与数量存在差异,且未发现与大肠杆菌相关的序列.A组与D组42日龄肉鸡回肠黏膜菌群的组成及多样性存在差异,尤其是乳杆菌属的组成比例,这种差异可能是抗生素持续压力的影响所致.

摘要： 试验旨在研究三种乳酸菌对蛋雏鸡盲肠微生物的影响.选取1日龄健康、体重相近的罗曼褐蛋公雏432只,随机分成A、B、C、D4个组,每组6个重复,每个重复18只鸡.A组为对照组,饲喂基础饲粮;B、C、D组为试验组,饲喂基础祠粮另分别添加粪肠球菌制剂、嗜酸乳杆菌制剂和乳双歧杆菌制剂(添加量均为:lx107CFU/g),试验期为42d.试验结束后,每处理组随机选取6只鸡(每重复1只,共24只),收集盲肠食糜样,并应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析微生物群落结构和组成的变化.结果表明:不同处理组间蛋雏鸡盲肠菌群均以Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)及Proteobacteria(变形菌门)3种为主.与对照组相比,试验组Faecalibacterium有益菌属的相对含量升高,而Clostridium(梭菌属)、Strepto-coccus(链球菌属)、Escherichia(埃希氏菌属)/Shigella(志贺氏菌属)等有害菌属的相对含量不同程度降低.从α多样性上看,粪肠球菌和乳双歧杆菌制剂组盲肠微生物丰度指数下降,而嗜酸乳杆菌制剂组丰度指数上升.同时,三种乳酸菌组多样性指数均下降.从β多样性上看,添加乳酸菌可使盲肠菌群差异变大,与对照组相比,粪肠球菌和乳双歧杆菌制剂组差异性大于嗜酸乳杆菌制剂组.由此可见,乳酸菌可改变蛋雏鸡盲肠菌群结构;添加乳酸菌一定程度上可促进有益菌生长,而抑制有害菌增殖;粪肠球菌和乳双歧杆菌添加效果优于嗜酸乳杆菌制剂.

摘要： CKD/ESRD时肠道菌群组成发生显著变化，益生菌减少，有害菌增多。细菌代谢产物也发生改变，肠源性毒素如硫酸吲哚、对甲酚等产生增多。肠道上皮屏障遭到破坏，细菌及其产物，肠道毒素进入血循坏，导致一系列并发症的发生发展。肠源性尿毒症毒素的影响及其作用机制，并如何有效清除此类毒素仍是今后继续研究的重点。

摘要： CKD/ESRD时肠道菌群组成发生显著变化，益生菌减少，有害菌增多。细菌代谢产物也发生改变，肠源性毒素如硫酸吲哚、对甲酚等产生增多。肠道上皮屏障遭到破坏，细菌及其产物，肠道毒素进入血循坏，导致一系列并发症的发生发展。肠源性尿毒症毒素的影响及其作用机制，并如何有效清除此类毒素仍是今后继续研究的重点。

摘要： CKD/ESRD时肠道菌群组成发生显著变化，益生菌减少，有害菌增多。细菌代谢产物也发生改变，肠源性毒素如硫酸吲哚、对甲酚等产生增多。肠道上皮屏障遭到破坏，细菌及其产物，肠道毒素进入血循坏，导致一系列并发症的发生发展。肠源性尿毒症毒素的影响及其作用机制，并如何有效清除此类毒素仍是今后继续研究的重点。

摘要： CKD/ESRD时肠道菌群组成发生显著变化，益生菌减少，有害菌增多。细菌代谢产物也发生改变，肠源性毒素如硫酸吲哚、对甲酚等产生增多。肠道上皮屏障遭到破坏，细菌及其产物，肠道毒素进入血循坏，导致一系列并发症的发生发展。肠源性尿毒症毒素的影响及其作用机制，并如何有效清除此类毒素仍是今后继续研究的重点。

摘要： 基因测序技术是生命科学研究的重要手段.经过数十年的发展,基因测序技术在测序通量和功能方面都有很大进展,成本也降低很多,己成为草业科学发展的重要研究手段.本文就基因测序技术在青贮技术领域的应用进行归纳总结.

摘要： 本发明公开了一种检测水中总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌的测定方法，所述测定方法包括以下几个步骤：步骤一：试剂和材料的准备；步骤二：仪器和设备的准备：步骤三：样品采集；步骤四：样品测定试验；步骤五：试验结果的计算和表示；所述步骤一中准备的试剂和材料包括：(1)培养基：采用Minimal Medium ONPG‑MUG培养基，且每100ml样品需使用培养基粉末2.7g±0.5g；(2)硫代硫酸钠(Na2S2O3·5H2O)；(3)乙二胺四乙酸二钠(C10H14N2O8Na2·2H2O)；(4)硫代硫酸钠溶液：ρ(Na2S2O3)＝0.10g/ml(称取15.7g硫代硫酸钠，溶于适量水中，定容至100ml，临用现配)。该检测水中总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌的测定方法，能保证测定结果的精密度和准确度，极大程度的减小了测定结果的偏差。

摘要： 本发明公开了一种复合菌，其原料为按照以下用量百分比配置：天门冬氨酸1.10％，苯氨基酸丙酸0.23％，白氨酸0.41％，谷氨酸7.19％，苏氨酸0.18％，氨基丙酸1.7％，精氨酸0.20％，甘氨酸0.33％，缬氨酸0.28％，维生素B2 85.0PPM，烟碱酸38.5PPM，维生素H 86ng/g，叶酸305ng/g，维生素B6 180ng/g，泛酸2.0ng/g。本发明通过合理搭配，配方中完全不含化学药物，均是纯天然的草本植物。

摘要： 本发明涉及一种定向增殖用于肠道菌群移植的肠道菌群制剂和制作方法及应用，包括体积比为2:2:1:(0.5～1.5)的GAM培养基、芦荟大黄素溶液、PBS缓冲液和肠道微生物溶液，芦荟大黄素溶液的浓度为9.93～10.13g/mL，肠道微生物溶液的质量浓度为4～6％。本发明通过体外模拟肠道环境，并以健康人体粪便中收集的肠道菌群作为样本，将芦荟大黄素溶液应用到促进益生菌增殖发酵，为临床应用提供科学依据，达到高效制备益生菌剂，用于粪菌移植中，可以有效调节肠道菌群状态，缓解便秘以及克罗恩等炎症，从而降低结肠癌患病率。

摘要： 本发明公开了一种基于乡土菌群和特定菌群制备锑矿区复合菌液方法，具体包括以下步骤：步骤一、样本筛选；步骤二、乡土菌群确定及培养；步骤三、乡土菌群制备；步骤四、复合菌液制备；步骤五、土壤提升测定；步骤六、分析定稿；本发明涉及土壤修复技术领域。该基于乡土菌群和特定菌群制备锑矿区复合菌液方法，对重金属污染物进行针对性的采样试验，制得乡土菌群，与特定菌群进行不同比例的配比后，通过大田施用，获取明确实际改良数据，从而整理出最优的含有乡土菌群和特定菌群的复合菌液的制备方法，制备出最优情况下的复合菌液，实现对土壤质量显著提升的同时，提高作物生长和肥料利用率，并有效降低作物的重金属含量。

摘要： 本发明公开了一种菌群功能检测实验用菌群的培养装置，包括壳体，所述壳体内壁固定连接有培养箱，所述培养箱底部开设有条形腔，所述条形腔顶部开设有多个框口，多个所述框口内壁均固定连接有弹性膜，所述条形腔内壁通过第一管与培养箱内壁连通，所述第一管内安装有第一电磁阀，所述壳体侧壁固定连接有固定筒，所述固定筒内壁密封滑动连接有滑板，所述滑板下端通过弹簧与固定筒底部弹性连接，所述滑板将固定筒内分为吸液室和吸气室，所述吸气室内壁固定连接有单向吸气管。本发明滑板上下滑动时使得吸气室和吸液室空间不断变化，进而可以对培养箱内同时添加空气和营养液，避免使用过多的设备，使得培养时占据面积较大，操作不便。

摘要： 本发明提供一种用于菌群移植的肠道菌群凝胶剂制备方法，本制备方法制备出的菌群凝胶剂较于菌液具有黏稠度高、易制备、便于存储的优势。试验表明，在‑20°C条件下保存30天稳定性较好，菌群丰度变化不大。特别是对于菌群移植临床治疗中的一些特殊患者，可以作为一种提高肠道内菌群停留时间的剂型进行推广使用，提高治疗的效果。

摘要： 本发明公开一种基于测定肠道菌群16S rRNA序列，确定肠道菌群种类的方法，通过构建已知肠道菌群16S rRNA基因参比序列库，然后测定临床样本中16S rRNA序列，将两者进行比对并进行菌种鉴定确定致病菌的种类，并且与不同地区肠道菌群丰度注释数据库比较，确定待测样本来源的地区归属以及病理学特性以提供针对性的治疗。本发明的方法可快速确定肠道菌群具体种类并且提供致病菌致病注释数据，确定病患地区来源；提高了检测效率和精准度，可适用于常规肠道菌群检测、流行病预警和防控、辅助临床诊断等多类健康相关领域。

摘要： 本实用新型公开了水质总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌的测定装置，包括垂直对称设置的测定结构，测定结构包括等距设置的测定组件，所述测定组件包括上端面可拆卸安装有盖体的培养基，所述盖体的外缘面上呈环形阵列开设有弧形通气槽，且盖体的上端面居中可旋转安装有旋钮，所述旋钮的下端面居中构造有转轴，所述转轴远离旋钮的一端延伸入盖体内，且转轴的外缘面上呈环形阵列构造有连接轴，所述连接轴远离转轴的一端构造有用于抵接密封弧形通气槽的弧形抵接板，所述培养基的上端面边缘位置呈环形阵列开设有弧形定位插槽，该水质总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌的测定装置，结构合理，有利于保障测定结果的准确性，实用性强。

摘要： 本发明公开了骨桥蛋白在肠道菌群体外培养过程中调节菌群结构的应用：在肠道菌群的培养基中添加骨桥蛋白作为培养基组分。在添加OPN至培养基时，体外培养获得的肠道菌群与其初始的菌群结构更为相近，主要体现在除核心菌群以外的菌群种类与原始菌群更相近。这将有利于后续将体外培养获得的肠道菌群应用于人体肠道代谢、微生态中菌群的遗传特性及功能等领域的研究。

摘要： 本发明公开了骨桥蛋白在肠道菌群体外培养过程中调节菌群结构的应用：在肠道菌群的培养基中添加骨桥蛋白作为培养基组分。在添加OPN至培养基时，体外培养获得的肠道菌群与其初始的菌群结构更为相近，主要体现在除核心菌群以外的菌群种类与原始菌群更相近。这将有利于后续将体外培养获得的肠道菌群应用于人体肠道代谢、微生态中菌群的遗传特性及功能等领域的研究。