土壤细菌

摘要： 分析甘蔗间作西瓜对甘蔗产量、总经济效益、根际土壤生态及理化性质的影响,旨在探究甘蔗间作西瓜模式的生态效应,为进一步推广及应用甘蔗间作西瓜模式提供理论依据和技术支撑。基于传统和现代高通量测序技术,分析间作和单作甘蔗产量、总经济效益、根际土壤理化性质及根际土壤细菌群落结构变化。与甘蔗单作(CK)相比,甘蔗间作西瓜(TM)具有提高甘蔗产量和总经济效益的效果;对甘蔗根际土壤有机质、全氮、全磷、全钾、碱解氮、速效磷和速效钾含量无显著影响;同时,甘蔗间作西瓜对甘蔗根际土壤细菌多样性和丰富度亦无显著影响。另一方面,门分类水平,甘蔗间作西瓜虽然增加了放线菌门(Actinobacteria)和其他(others)门类优势细菌的相对丰度占比,但亦缺失了浮霉菌门(Planctomycetes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等门类优势细菌的富集;属分类水平,热酸菌属(Acidothermus)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、norank_o_SC-I-84、Bryobacter、链霉菌属(Streptomyces)、norank_f_DA111、Candidatus_Solibacter、酸杆菌属(Acidibacter)和norank_f_Acidobacteriaceae_Subgroup_1_则是甘蔗单作(CK)模式下甘蔗根际土壤中特有的优势细菌属;与之相比,小单孢菌属(Micromonospora)、norank_f_Anaerolineaceae、unclassified_f_Micrococcaceae、norank_o_JG30-KF-CM45、norank_f_Elev-16S-1332、norank_c_Actinobacteria、卢得曼氏菌属(Luedemannella)、unclassified_f_Intrasporangiaceae、norank_f_Nitrosomonadaceae、unclassified_f_Nocardioidaceae、norank_c_S085和Defluviicoccus则是甘蔗间作西瓜(TM)模式下,甘蔗根际土壤中特有的优势细菌属。基因功能预测结果显示,甘蔗间作西瓜并没有显著改变甘蔗植株根际土壤细菌的主体功能。与甘蔗单作相比,甘蔗间作西瓜具有提高甘蔗产量和总经济效益的效果;虽然没有显著改变甘蔗根际土壤理化性质,同时亦没有显著提升甘蔗根际土壤细菌多样性、丰富度以及细菌主体功能,仅改变了部分甘蔗根际土壤细菌的群落组成,富集了诸如小单孢菌属(Micromonospora)等特有的优势细菌属。综上所述,甘蔗间作西瓜有助于提高甘蔗产量和总经济效益,虽不能显著提升甘蔗根际土壤肥力,但亦没有造成甘蔗根际土壤细菌生态功能失衡或劣化,只是改变了部分甘蔗根际土壤细菌群落组成,但间套作西瓜富集的特有优势细菌属,诸如小单孢菌属(Micromonospora)属细菌是具有增强甘蔗植株抗性功能的有益细菌属。

摘要： 为探讨生物有机肥稻田水稻不同生长时期根际土壤细菌群落动态变化及其和环境因子的相关性,利用高通量测序技术对生物有机肥稻田水稻分蘖期、拔节期、抽穗期和成熟期4个时期的根际土壤细菌进行高通量测序及分析。结果显示,测序共获得404 183个有效序列,可分为55个门,171个纲,385个目,603个科,1 010个属,2 139个种。α多样性分析显示,ACE多样性指数在生长时期呈现先下降后上升的趋势,分蘖期和拔节期的香农多样性指数均与成熟期差异显著。4个生长时期的优势菌门相似,优势菌门(相对丰度>10%)有放线菌门(Actinobacteriota)、绿弯菌门(Chloroflexi)、变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteriota)。β多样性分析显示,4个生长时期的细菌群落结构具有一定的差异性,成熟期和其余3个时期的群落结构差异显著。冗余分析(RDA)表明,pH值是影响细菌群落的第1因子,主要菌门都与pH值呈正相关,其中绿弯菌门受pH值影响最大。相对丰度值最高的放线菌门则受含量影响最大。在生物有机肥稻田中,随着水稻的生长发育,根际土壤的细菌群落结构会随着土壤理化因子发生一定变化,说明土壤理化因子是影响细菌群落的主要因素。

摘要： 为研究不同连作、轮作组合对土壤细菌群落和作物产量的影响,选择北方旱地常见种植作物甘蓝(C)、菜豆(B)和玉米(M),以3种作物轮作下甘蓝-玉米-甘蓝(CMC)、菜豆-玉米-甘蓝(BMC)、甘蓝-甘蓝-甘蓝(CCC)、甘蓝-玉米-菜豆(CMB)、菜豆-玉米-菜豆(BMB)、菜豆-菜豆-菜豆(BBB)、甘蓝-甘蓝-玉米(CCM)、甘蓝-菜豆-玉米(CBM)、菜豆-菜豆-玉米(BBM)、菜豆-甘蓝-玉米(BCM)共10种轮作组合为对象,利用IlluminaHiSeq高通量测序平台,基于16S rRNA基因序列扩增子测序,研究10种轮作模式下耕层土壤细菌群落结构和多样性的变化,分析其不同变化对作物产量的影响。结果表明:各处理间细菌OTU数目差异较小,丰富度间没有差异;前茬种植作物为甘蓝时,CCC处理特有OTU数为2,BMC处理特有OTU数为1;前茬种植作物为菜豆时,BBB处理无特有OTU,CMB处理轮作特有OTU数为1;前茬种植作物为玉米时,CCM、CBM、BCM处理均有1个特有OTU。BCM处理的土壤细菌丰富度指数(Ace指数和Chao1指数)显著低于CCC处理,但CCC、BCM处理与其余处理间无显著差异;与CCC处理相比,BCM处理的Ace指数降低了2.6%,Chao1指数降低了2.5%。CMC、BMC、CCC、BMB、CCM、BBM处理的土壤细菌多样性指数(Shannon指数)较CBM处理显著提高了3.3%~3.6%。与连作相比,CBM处理土壤细菌相对丰度和群落结构变化最大,BCM处理次之;与CCC处理相比,轮作能够降低土壤细菌丰富度和土壤细菌多样性。CMB和BMB处理细菌优势门(相对丰度>10%)为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes),其余处理细菌优势门为变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、厚壁菌门(Firmicutes);各处理相对丰度最大的门是变形菌门(25.0%~31.1%)。与连作相比,CBM处理显著降低酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门相对丰度,显著提高拟杆菌门相对丰度。属水平相对丰度聚类热图显示,CMC、BBB、CCM处理与BMC、BBM、BCM处理土壤细菌群落相似性较高,CCC、CMB、BMB处理与CMC、BMC、BBB、CCM、BBM、BCM处理群落相似性次之,CBM处理与其余9种处理细菌群落差异最大。前茬种植作物相同时,各处理产量均无显著差异,其中CMC、BMB、BBM处理产量最高。综合而言,菜豆-菜豆-玉米为最优轮作组合。

摘要： 土壤微生物群落特征指示着草地的质量和健康状况。本研究以青海省贵南县的天然草地(NG)、沙化草地(DG)、草本人工恢复草地(AG)和灌木人工恢复草地(AS)4种草地类型为研究对象,采用qPCR和Illumina MiSeq高通量扩增子测序技术研究了土壤细菌群落生物量、多样性及其结构的变化,结合植被和土壤属性剖析了高寒草地土壤细菌群落演变的关键影响因子及其贡献。结果表明:草地沙化显著(P<0.05)降低了土壤细菌群落的生物量和α多样性,人工植被重建则促进了土壤细菌群落生物量和α多样性的恢复,22年后基本达到未退化前的水平。草地沙化显著(P<0.05)增加了芽单胞菌门(Gemmatimonadota)的相对丰度,而变形菌门(Proteobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetota)的相对丰度则显著降低(P<0.05);人工植被重建促进了优势细菌门逐渐向NG方向演变,22年后绝大部分优势细菌的相对丰度基本恢复到未退化之前的状态。然而,DG、AG和AS与NG的土壤细菌群落结构相似性不高,而AG和AS的群落结构则高度相似。土壤细菌群落结构与绝大多数植被和土壤理化指标显著(P<0.05)正相关,植被属性对其群落结构变化的解释度(10.0%)比土壤物理属性(6.3%)和化学属性(1.9%)更高,植被与土壤所有指标共解释了72.0%的土壤细菌群落结构的变化,表明植被和土壤通过相互作用共同决定了高寒草地土壤细菌群落结构的演变。因此,加强对植被和土壤的保护,防止草地退化,并对沙化草地进行人工植被重建,对于保护和恢复青藏高原高寒草地土壤细菌群落具有重要的生态意义,而选择利用灌木或草本进行人工植被重建对表层土壤细菌群落的影响区别不大。

摘要： 【目的】为明晰砂铁矿区最适宜的植被修复措施,探讨最适宜砂铁矿区修复措施。【方法】采用高通量测序技术,以准噶尔荒漠东北部青河县砂铁矿为研究对象,分析不同修复措施下土壤养分差异及土壤细菌多样性和群落结构特征。【结果】不同处理下土壤养分含量有显著差异,其中D处理土壤有机质含量最高,>B>E>C>A;在土壤细菌门水平,放线菌门、变形菌门和绿弯菌门是其主要类群,相对丰度均超过75%,但细菌多样性及群落结构在处理间存在显著差异,均表现为D处理土壤细菌多样性最高,>E>C>A>B;冗余分析结果表明,土壤有机碳和土壤全钾主要影响D处理土壤细菌多样性及群落结构,土壤全氮主要影响B处理土壤细菌多样性及群落结构,土壤全磷主要影响E处理土壤细菌群落结构及多样性。【结论】综合得出半灌木+灌木+多年生草本+一年生草本混播(D)以及围栏封育(E)是最有效的砂铁矿区生态修复措施。为加快修复进程可以为D处理添加有机质和钾肥,E处理添加磷肥。

摘要： 【目的】为研究不同树龄的茶树土壤细菌群落变化规律。【方法】采用16S rRNA高通量绝对定量测序的方法,选取树龄10年(10yrs)、40年(40yrs)、80年(80yrs)和100年以上(100yrs)的茶树土壤为研究对象,同时选取相邻没有茶树种植历史的林地(0yrs)土壤作为对照。【结果】土壤细菌群落多样性表现为10yrs>0yrs>40yrs>80yrs>100yrs;Acidobacteria(酸杆菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Chloroflexi(绿弯菌门)、Planctomycetes(浮霉菌门)、Actinobacteria(放线菌门)、Myxococcous(粘球菌门)、Gemmatimonadetes(芽单胞菌门)是林地和茶树土壤细菌主要的优势门,占了整个细菌群落的76.30%~88.90%;植茶后土壤细菌总绝对丰度表现为40yrs>80yrs>10yrs>100yrs, 0yrs和80yrs的总绝对丰度差异较小;基于各样本的ASV绘制的韦恩图分析,植茶后特有的ASV个数随树龄的增加而减小;Heatmap(热图)和PCoA(主坐标)分析共同表明,40yrs和80yrs的土壤细菌群落结构较相似,其他树龄茶树土壤和林地土壤的细菌群落结构差异较大。【结论】随着茶树树龄的增加,土壤细菌群落多样性降低;土壤细菌绝对丰度随树龄增加呈先增加后减小的趋势。

摘要： 自然界万事万物都有相生相克之道,蔬菜种植也不例外。有的蔬菜种在一起可以相互促进生长,实现增产增收。而有的蔬菜种在一起会相互伤害,造成减产甚至绝收。相生的蔬菜1.葱蒜类蔬菜与十字花科蔬菜葱蒜类蔬菜如大葱、大蒜、韭菜等蔬菜的根部在生长时期会分泌对土壤细菌、真菌有抑制性的物质,可以安排其与十字花科蔬菜如大白菜、甘蓝、萝卜等进行间作或套种。

摘要： 为明确不同种类设施蔬菜土壤微生物多样性,利用高通量测序技术对不同种类设施蔬菜土壤细菌V3-V4区进行测定,分析不同设施蔬菜土壤细菌群落特点。结果表明,不同种类蔬菜土壤细菌多样性不同,青椒土壤细菌多样性最高,黄瓜土壤细菌多样性最低。物种分类显示,青椒土壤中细菌隶属于33门,68纲,112目,231科,533属;番茄土壤细菌隶属于30门,62纲,102目,209科,455属;黄瓜土壤细菌隶属于28门,62纲,105目,216科,518属。其中青椒与番茄土壤理化性质相近,群落结构相似,而黄瓜土壤有机质和全氮含量较低,且弱酸高盐,土壤群落结构与前两者差异较大。

摘要： 为探究三江源区未退化高寒草甸与退化高寒草甸土壤细菌群落结构及多样性,采用巢氏取样方法和高通量测序技术,系统地对土壤细菌群落多样性、群落组成和结构及其与环境因子间的关系进行研究分析。结果表明,草地退化对植被和土壤都产生影响,草地退化降低了植被盖度和丰富度,使得土壤pH值增加,土壤向碱性化过渡,而土壤全氮、有机质和电导率的含量显著降低(P<0.05)。高通量测序得到优质有效细菌序列2168457条和71798个OTUs。草地退化对土壤细菌群落α多样性和物种组成都有显著影响(P<0.05)。其中,草甸退化导致土壤细菌物种指数(Observed Richness)、多样性指数(Shannon Index)和chao 1指数上升;变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、奇古菌门(Thaumarchaeota)为主要优势菌门;草甸退化提高了放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度,但却降低了疣微菌门(Verrucomicrobia)的相对丰度。通过PCoA和Dissimilarity检验的方法表明草地退化显著改变了退化草地土壤细菌群落结构。土壤异质性对土壤细菌群落具有一定的影响,其中,驱动土壤细菌群落的主要环境因子是土壤pH、有机质含量和总氮含量。该研究分析了细菌群落多样性和组成结构,揭示了退化高寒草甸土壤细菌群落多样性变化规律,为土壤微生物对草地退化方面的研究提供了参考。

摘要： 【目的】研究杉木林转为油茶林后土壤细菌群落结构及多样性,为油茶林的可持续经营提供理论基础。【方法】通过高通量测序技术分析杉木林转为油茶林后土壤细菌群落结构及其与土壤理化性质的相关关系。【结果】杉木林和油茶林中共有OUT 2845个,30个门,88个纲,195个目,295个科和887个属。2种林分类型中主要细菌群落有变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门、浮霉菌门和Myxococcota,其中优势菌门为变形菌门、酸杆菌门和绿弯菌门,3个优势菌门的丰度占细菌总量的69.5%~73.9%。杉木林土壤中的变形菌门显著高于油茶林(P<0.05);而绿弯菌门和Myxococcota则显著低于油茶林(P<0.05);匿杆菌门、Spirochaetota、达达菌门和MBNT15为油茶林特有菌门。油茶林的土壤细菌多样性和丰度高于杉木林,杉木林的细菌物种在土壤中分布较油茶林更为集中,2种植被土壤中已鉴别出的优势菌属为Acidibacter、热酸菌属、短根瘤菌属,杉木林土壤中热酸菌属显著高于油茶林(P<0.05),而Bryobacter显著低于油茶林(P<0.05)。相关分析表明,土壤有效磷、碱解氮和含水率对细菌群落结构影响较大,在3个主要优势菌门中绿弯菌门与全氮极显著负相关(P<0.01),与土壤含水率、全磷、碱解氮和有机质显著负相关(P<0.05)。在油茶林特有菌门中匿杆菌门、达达菌门与速效钾分别呈极显著正相关(P<0.01)和显著正相关(P<0.05),而Spirochaetota与土壤有效磷极显著正相关(P<0.01)。【结论】以上结论表明林地植被类型转变对土壤细菌群落有显著影响,为了解杉木林转为油茶林土壤细菌群落组成及多样性提供理论依据,对于营造可持续发展的油茶林有重要参考价值。

摘要： 秸秆还田能调节土壤微生物群落结构和多样性,微生物多样性和群落结构一定程度上反映农田生态系统基本情况.目前长期保护性耕作和秸秆还田土壤微生物群落结构和多样性研究较多,并形成一致结论.认为长期保护性耕作能改善土壤微生物群落结构,提高土壤微生物多样性.然而,短期玉米秸秆还田土壤微生物群落结构和多样性研究尚未形成一致的结论.Jackson等和Minoshima等研究皆表明短期耕作改变了土壤细菌和真菌生物量.但也有部分研究指出短期耕作并未影响微生物群落结构和多样性.玉米秸秆旋耕还田和深翻还田增加10-30cm土层细菌多样性和相对丰度;秸秆深翻还田提高土壤纤维素降解菌、固氮、解磷、解钾功能细菌多样性。

摘要： 目的:了解抗重茬复合微生物菌剂对重茬苹果园土壤细菌数量及多样性的影响.rn 方法:对重茬苹果园土壤进行复合微生物菌剂处理后,采用自动核糖体内转录间隔区序列分析方法(Automated ribosomal intergenicspacer analysis,ARISA)对新茬苹果园、重茬苹果园土壤细菌群落多样性进行分析.rn 结果:经复合微生物菌剂处理两年后,重茬果园土壤OTUs总数和Shannon-Weiner指数分别为250和4.44,新茬果园OTUs总数和Shannon-Weiner指数分别为234和3.81,经One-Way ANOSIM法分析得到二者差异系数P分别为0.1083和0.0843.另外,重茬园和新茬园共享核心OTUs有89个,二者的Jaccard群落相似性系数为0.47,相似程度中等.rn 结论:复合微生物菌剂具有提高重茬果园土壤微生物多样性,促进重茬苹果园土壤微生物生态系统恢复的作用.

摘要： 本文以长江中游芦苇滩地为研究对象,利用微生物分离培养计数方法和PCR—DGGE技术重点研究了人工杨树林对芦苇滩地土壤细菌种群的影响.结果表明:与芦苇地相比,人工杨树林根际土、根表土和0-10cm土层中的氮、速效磷和总有机碳的含量都明显降低;人工杨树林下根际土中的微生物数量都比芦苇地的低,而其根表土中则是细菌、真菌数量低于芦苇地,放线茵比芦苇地高;就4种功能细菌来说,人工杨树林根际土的纤维素茵、反硝化茵、硝化细菌和氨氧化细菌的数量则比芦苇地低,而根表土中除了氨氧化细菌外,其他3种功能细菌含量又比芦苇地的高.4种功能细菌数量在不同的土壤剖面中的分布也各不相同:在0-10cm土层中,人工杨树林的纤维素菌和氨氧化细菌的数量高于芦苇地,而其余2种功能菌则低于芦苇地;在10-25cm土层中,人工杨树林的纤维素菌和硝化细菌含量低于芦苇地,反硝化茵的含量却高于芦苇地,而氨氧化茵含量相同;在25-60cm土层中,除了纤维素茵,其他3种功能细菌含量都是人工杨树林低于芦苇地.通过系统进化树分析发现,滩地中普遍存在的细菌类群为α变形茵纲、β变形茵纲和硝化螺旋菌纲,而人工杨树林和芦苇地的根表土、根际土和0-10cm土层均存在各自专有的细菌种群,表明人工杨树林对芦苇滩地土壤中细菌种群产生了一定的影响.

摘要： 本文采用PCR-DGGE图谱分析技术分析了炼山对桉树人工林土壤细菌群落多样性的影响,拟为评价炼山的生态效果以及恢复桉树人工林土壤生态系统提供理论依据.结果表明:与非炼山方式相比,炼山方式导致桉树人工林土壤细菌多样性指数(Shannon-Wiener index)和丰度下降,尤其在0～3cm的表层土壤体现更为显著.炼山不利于改良或保持稳定的桉树人工林地土壤生态系统.另一方面,与阔、针叶混合林相比,单一的桉树人工林土壤细菌多样性呈现下降的趋势.表明单一地栽植桉树不利于保持或提升林地土壤微生物多样性.在人工桉树林区有必要与阔、针叶混合林等其它林木类型实行定期的轮作制度,以免长期栽植桉树导致林地土壤的生态环境受到破坏.

摘要： 本文以桂林丫吉岩溶试验场为例,并以思赖碎屑岩区为对照,研究了典型岩溶生态系统土壤细菌多样性的时空特征,并对土壤细菌多样性与土壤CA活性的关系进行了初步分析,获得的主要结果如下:(1)各样地土壤细菌多样性指数在2.57～3.91之间,UPGMA聚类分析表明土壤细菌多样性受地貌部位和季节的影响,岩溶试验场同一地貌部位,土壤细菌群落组成最相似.(2)对2012年2月份各样地土壤样品DGGE图谱的差异条带进行了回收测序分析,结果表明,可培养细菌有变形菌属Proteobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)等,大多数为不可培养微生物,说明在岩溶土壤环境中存在大量的不可培养微生物.(3)土壤细菌多样性与土壤碳酸酐酶活性具有一定的相关性,且相关性受季节的影响.本文结果为深入研究微生物及其碳酸酐酶在岩溶碳汇中的作用提供了一定的科学依据.

摘要： 本研究选取对与大豆品种中黄13竞争结瘤能力较强的菌株B.japonicum 4534和较差的菌株B.japonicum 4222作为研究材料，选取根际分泌物对nod基因表达的影响作为根际分泌物收集及其诱导结瘤效果的评价指标，采用比较蛋白质组学技术分析了这两株根瘤菌在大豆根际分泌物处理下的蛋白差异。结果表明在在大豆根际分泌物的处理下，菌株4534有65个差异表达蛋白，菌株4222有29个差异表达蛋白。研究结果表明大豆根际分泌物的作用不仅局限于对大豆根瘤菌结瘤基因表达的诱导。在大豆根际分泌物的诱导下，与新陈代谢和环境适应相关的蛋白/酶的表达上调在竞争结瘤能力较强的菌株中出现的更多，其具体机制还需要进一步研究。

摘要： 本研究选取对与大豆品种中黄13竞争结瘤能力较强的菌株B.japonicum 4534和较差的菌株B.japonicum 4222作为研究材料，选取根际分泌物对nod基因表达的影响作为根际分泌物收集及其诱导结瘤效果的评价指标，采用比较蛋白质组学技术分析了这两株根瘤菌在大豆根际分泌物处理下的蛋白差异。结果表明在在大豆根际分泌物的处理下，菌株4534有65个差异表达蛋白，菌株4222有29个差异表达蛋白。研究结果表明大豆根际分泌物的作用不仅局限于对大豆根瘤菌结瘤基因表达的诱导。在大豆根际分泌物的诱导下，与新陈代谢和环境适应相关的蛋白/酶的表达上调在竞争结瘤能力较强的菌株中出现的更多，其具体机制还需要进一步研究。

摘要： 本研究选取对与大豆品种中黄13竞争结瘤能力较强的菌株B.japonicum 4534和较差的菌株B.japonicum 4222作为研究材料，选取根际分泌物对nod基因表达的影响作为根际分泌物收集及其诱导结瘤效果的评价指标，采用比较蛋白质组学技术分析了这两株根瘤菌在大豆根际分泌物处理下的蛋白差异。结果表明在在大豆根际分泌物的处理下，菌株4534有65个差异表达蛋白，菌株4222有29个差异表达蛋白。研究结果表明大豆根际分泌物的作用不仅局限于对大豆根瘤菌结瘤基因表达的诱导。在大豆根际分泌物的诱导下，与新陈代谢和环境适应相关的蛋白/酶的表达上调在竞争结瘤能力较强的菌株中出现的更多，其具体机制还需要进一步研究。

摘要： 本研究选取对与大豆品种中黄13竞争结瘤能力较强的菌株B.japonicum 4534和较差的菌株B.japonicum 4222作为研究材料，选取根际分泌物对nod基因表达的影响作为根际分泌物收集及其诱导结瘤效果的评价指标，采用比较蛋白质组学技术分析了这两株根瘤菌在大豆根际分泌物处理下的蛋白差异。结果表明在在大豆根际分泌物的处理下，菌株4534有65个差异表达蛋白，菌株4222有29个差异表达蛋白。研究结果表明大豆根际分泌物的作用不仅局限于对大豆根瘤菌结瘤基因表达的诱导。在大豆根际分泌物的诱导下，与新陈代谢和环境适应相关的蛋白/酶的表达上调在竞争结瘤能力较强的菌株中出现的更多，其具体机制还需要进一步研究。

摘要： 本研究选取对与大豆品种中黄13竞争结瘤能力较强的菌株B.japonicum 4534和较差的菌株B.japonicum 4222作为研究材料，选取根际分泌物对nod基因表达的影响作为根际分泌物收集及其诱导结瘤效果的评价指标，采用比较蛋白质组学技术分析了这两株根瘤菌在大豆根际分泌物处理下的蛋白差异。结果表明在在大豆根际分泌物的处理下，菌株4534有65个差异表达蛋白，菌株4222有29个差异表达蛋白。研究结果表明大豆根际分泌物的作用不仅局限于对大豆根瘤菌结瘤基因表达的诱导。在大豆根际分泌物的诱导下，与新陈代谢和环境适应相关的蛋白/酶的表达上调在竞争结瘤能力较强的菌株中出现的更多，其具体机制还需要进一步研究。

摘要： 本发明涉及一种新型细菌集合体EBC1000(KCTC 0652 BP)和一种用该细菌集合体EBC1000对含氯化合物及包含在工业废水、废物和土壤中的难分解有毒化学物质进行生物处理的方法。新型细菌集合体EBC1000(KCTC 0652 BP)由易培养的好氧细菌组成，可用于降解含氯化合物和包含在工业废物中的，高浓度的废弃的酸性或碱性难分解有毒化学物质，如IPA，MC，DMA，AN，SHS，BD，Tamol-SN，EDTA，FES，TDDM，PMH，DEHA，MeOH，NaOH和CH

摘要： 本发明的目标是以编号KKP 2041p(IAFB工业微生物保藏中心–波兰农业及食品生物科技研究所)保藏的包含寡养单胞菌属种菌株2L、寡养单胞菌属种菌株5L、寡养单胞菌属种菌株6L、寡养单胞菌属种菌株3N、无色杆菌属种菌株4P、节杆菌属种菌株1N、短波单胞菌属种菌株2N、短波单胞菌属种菌株5N、短波单胞菌属种菌株6N、假单胞菌属种菌株3G、和假单胞菌属种菌株4的细菌菌株的组合物，包含这些菌株的组合物的生物除污菌苗(生物除污混合物)，菌苗在从土壤中去除污染物中的用途，以及处理污染土壤的方法。

摘要： 本发明涉及一种新型细菌集合体EBC1000(KCTC 0652 BP)和一种用该细菌集合体EBC1000对含氯化合物及包含在工业废水、废物和土壤中的难分解有毒化学物质进行生物处理的方法。新型细菌集合体EBC1000(KCTC 0652 BP)由易培养的好氧细菌组成,可用于降解含氯化合物和包含在工业废物中的,高浓度的废弃的酸性或碱性难分解有毒化学物质,如IPA,MC,DMA,AN,SHS,BD,Tamol－SN,EDTA,FES,TDDM,PMH,DEHA,MeOH,NaOH和CH

摘要： 本发明的目标是以编号KKP？2041p(IAFB工业微生物保藏中心–波兰农业及食品生物科技研究所)保藏的包含寡养单胞菌属种菌株2L、寡养单胞菌属种菌株5L、寡养单胞菌属种菌株6L、寡养单胞菌属种菌株3N、无色杆菌属种菌株4P、节杆菌属种菌株1N、短波单胞菌属种菌株2N、短波单胞菌属种菌株5N、短波单胞菌属种菌株6N、假单胞菌属种菌株3G、和假单胞菌属种菌株4的细菌菌株的组合物，包含这些菌株的组合物的生物除污菌苗(生物除污混合物)，菌苗在从土壤中去除污染物中的用途，以及处理污染土壤的方法。

摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组学的土著细菌修复石油污染土壤的方法，包括：(1)石油降解菌的筛选、富集与培养，其中以苯作为诱导和筛选条件；(2)混合培养细菌多样性分析；(3)混合细菌石油污染物降解能力测定；(4)混合细菌对土壤石油污染物降解效果的确定以及最优化降解体系构建；(5)土壤宏基因组学测序及其数据分析；(6)土壤宏基因组学分析关键降解酶丰度组间差异性；(7)氢供体降解系统构建方法。本发明在常温及低温条件下通过原位土著细菌实现的石油烃降解，即苯诱导混合细菌优化降解和氢供体降解。氢供体降解可以持续进行，并缓慢恢复土壤的微生态环境；修复土壤生态过程中无二次污染。

摘要： 本发明公开了一种利用发光细菌对土壤中有效态重金属毒性进行检测的方法，在待测土壤区域内，采集耕作层混合土样，置于阴凉处风干，去除土壤中石块、树枝杂物后，过筛均质，避光保存；称取所得样品，加入提取液，再将其置于水平震荡箱中充分反应，待反应结束之后过滤，收集滤液；将滤液pH值调节为中性，然后加入发光稳定的发光细菌菌液，待其稳定后，测定发光强度，以空白发光细菌菌液为对照，计算发光抑制率。

摘要： 本发明公开了一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法，其包括步骤为：步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库；步骤二、完成对土壤/植物样品DNA的提取；步骤三、完成样品的16S rRNA基因测序，获得测序下机数据；步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库，获得代表性序列；步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌，得到最终的ASV物种表，通过R语言对ASV物种表中不同样品的致病细菌组成、多样性特征等进行可视化作图。本发明能快速、精准检测致病菌，且不易受到样品污染的影响，可而可实现快速、全面、准确检测致病菌的目标。

摘要： 本实用新型属于土壤采样技术领域，且公开了一种土壤生物细菌研究用土壤采样装置，包括机壳，所述机壳的顶部固定安装有电机，所述机壳的上端固定焊接有扶手，所述电机的输出轴固定安装有螺杆，所述螺杆的外表面固定焊接有绞龙，所述机壳外侧的中部固定安装有底板，所述底板环形等角度固定安装有四个二号套杆，所述二号套杆的内部均固定安装有弹簧。本实用新型通过设置有电机、螺杆与绞龙等达到了采样效率高的目的，使其达到了采样效率高的效果，首先根据需要泥土的大小，来按压旋转杆的力度，来调节搅碎块与引导管的间隙，进行旋转旋转杆，使研磨的泥土从引导管处排出进行收集，使其达到了土壤粉碎的效果。

摘要： 本发明公开了一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法，其步骤为：步骤一、构建MGEs数据库；步骤二、构建非冗余蛋白质集合；步骤三、使用Reads Mapping的方法对非冗余蛋白质集合进行MGEs信息注释，获取MGEs物种溯源信息；步骤四、通过筛选并去除冗余后构建MGEs物种溯源数据库；步骤五、对MGEs物种溯源数据库封装，搭建分析平台；步骤六、采集环境样品进行DNA抽提建库，用Illumina测序技术进行宏基因组测序分析，获取原始数据；步骤七、原始数据使用FastQC进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据Cleandata；步骤八、质控数据输入分析平台，获取MGEs物种溯源丰度表。本发明大大提高了MGEs分析的速度以及准确性，实现了基于宏基因组测序数据进行MGEs物种溯源的快速分析。

摘要： 本实用新型涉及农业机械设备技术领域，为克服现有土壤细菌病害防治设备的工作效率低的问题，提出一种针对土壤中细菌病害的微波防治的装置。该装置包括动力装置、牵引连接装置和底部设有行走机构的台架、取土装置、微波消杀装置、隔离防护舱和电源模块，所述取土装置包括取土挡板、传送带和分堆犁，微波消杀装置包括微波发生器、可伸缩波导管和波导管保护套，隔离防护舱由若干块挡板围成，电源模块包括电源单元和发电机。通过取土挡板将土壤取至传送带，利用分堆犁将土壤分为两堆，利用具有强穿透能力的微波对土壤进行杀虫灭菌；通过设置隔离防护舱和伸缩结构，防止微波泄露，提高作业安全性。