摘要:我们从感染家蚕体内分离到一株质型多角体病毒并且命名为BmCPV-Suzhou,通过对该病毒纯化,核酸提取与片段分离,经过RT-PCR和克隆测序,获得BmCPV1-Suzhou全基因组10条dsRNA(S1-S10)的完整序列并上传至GenBank。序列分析表明该病毒基因组序列全长24,758 bp,每个片段具有一个完整的开放阅读框。BLAST检索显示该病毒基因组各片段与已公开的部分BmCPV片段序列具有高度的同源性,达88%以上,而编码蛋白的氨基酸序列同源性达91%以上。RNA末端比较发现每个RNA片段的5’和3’末端分别存在保守序列:5’AGUAA………A/GxC/GGUUAGCC3’,并且在不同属的病毒之间也存在着特定的保守序列。通过对S2编码的RDRP进行的生物信息学分析发现RDRP的催化中心位于497-727氨基酸残基间;在S3编码的VP3蛋白序列中位于355-357和1220-1222间有两个细胞黏附序列RGD。系统进化分析表明 BmCPV-Suzhou与BmCPV(日本H株和中国广州株)以及LdCPV1、DpCPV1聚为一类,并且与中国广州株的亲缘关系最近,说明该病毒属于1型多角体病毒,可能和BmCPV-China起源于同一病毒。