要解决的问题:提供一种方法,该方法通过使用从蛋白质序列中预测的结构所预测的蛋白质序列的所有长度和所有位置的序列片段的熵,来确定首先对哪个序列片段进行结构优化进行蛋白质三维结构预测。
解决方案:具有短序列片段的蛋白质的结构优化比具有长序列片段的蛋白质的优先级高,并且具有相同长度且具有小熵的序列片段的优化优先级高,通过调度来执行随后要优化的序列片段,包括预先优化的片段的部分。至于每个片段的优化,通过计算片段中所有残基对的平均功率场电势之和和所有原子中分子动力学势之和,通过优化结构以使总能量最小来进行结构预测。假定所有残留碱基都是甘氨酸的片段,其中在每个片段的两端将CO和HH加入到残留碱基中。
版权:(C)2010,日本特许厅&INPIT
公开/公告号JP2010134514A
专利类型
公开/公告日2010-06-17
原文格式PDF
申请/专利权人 PANASONIC CORP;
申请/专利号JP20080307164
发明设计人 ONIZUKA KENTARO;
申请日2008-12-02
分类号G06F19;C07K14;G01N33/68;
国家 JP
入库时间 2022-08-21 19:05:30