用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法及定位方法

摘要

本发明涉及小麦功能基因定位技术领域，特别是涉及用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法，通过高通量测序平台进行测序获得转录组数据后与比对参考基因组进行比对分析，再进行转录本拼接、合并，再进行ORF预测，去掉重复区域的序列，将筛选的序列进行高密度探针合成，即得。基因定位方法包括：将小麦DNA打断成片段，再将打断后的小麦DNA与上述高密度探针进行杂交，磁珠富集后洗脱，再进行高通量测序、变异检测、统计定位即可。本发明解决现有技术中因小麦基因组庞大导致基因定位成本高昂的问题，通过设计超高密度多重引物探针，只针对于基因外显子序列进行测序，在同样的基因测序深度情况下，减少了80％的测序成本。