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群体遗传进化图谱及其构建方法

摘要

本发明提供了一种群体遗传进化图谱及其构建方法。该构建方法包括选择重组冷点区域;利用重组冷点区域的SNP位点构建系统进化树;对系统进化树进行聚类分析,确定物种之间的演化关系,从而获得群体遗传进化图谱。通过选取重组冷点区域(如着丝粒区域)的SNP位点进行系统进化树的构建,一方面由于重组发生率低,在亲本与子代之间稳定遗传,因而遗传进化关系明确,使得构建的系统进化树更准确,另一方面所选用的序列中SNP位点的数量相比全基因组序列的少,又较单倍型分析法中的SNP位点多和全面。因而,能够实现快速准确地构建系统进化树。

著录项

  • 公开/公告号CN110910959B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022.08.30

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国水稻研究所;

    申请/专利号CN201911068002.3

  • 申请日2019.11.04

  • 分类号G16B30/10(2019.01);G06F16/36(2019.01);

  • 代理机构北京康信知识产权代理有限责任公司 11240;

  • 代理人路秀丽

  • 地址 310006 浙江省杭州市富阳区水稻所路28号中国水稻研究所

  • 入库时间 2022-09-26 23:16:47

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