类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法

摘要

本发明涉及一种类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法。本发明采用高通量测序结合甲基化RNA免疫沉淀和RNA测序获得RA患者滑膜的全转录组m6A修饰，并进一步对下游信号通路进行富集。发现RA滑膜中有2025个转录本存在差异甲基化位点，其中1016个peaks显著上调，1009个peaks显著下调；通过m6A‑seq和RNA‑seq的联合分析显示，共有120个基因在m6A修饰和mRNA表达上都有显着变化；GO和KEGG分析表明，差异表达的m6A基因与巨噬细胞活化参与的免疫反应、血管内皮、MAPK信号通路、PI3K‑Akt信号等炎症过程密切相关。