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一种基于De Bruijn图的多序列比对方法

摘要

本发明提供了一种基于De Bruijn图的多序列比对方法,包括以下步骤:步骤S100,将输入序列分割成序列片段;步骤S200,利用序列片段构造De Bruijn图,每一序列片段为一节点;步骤S300,利用深度优先搜索算法剔除De Bruijn图中的环路;步骤S400,利用Bellman‑Ford算法获取最优权值路径作为中心序列;步骤S500,将中心序列和输入序列两两比对,并更新中心序列;步骤S600,更新后的中心序列再与输入序列两两比对,得到比对结果。

著录项

  • 公开/公告号CN115206434A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-10-18

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南京邮电大学;

    申请/专利号CN202210718465.5

  • 发明设计人 吴建盛;苗雨露;

    申请日2022-06-23

  • 分类号G16B30/10;

  • 代理机构南京正联知识产权代理有限公司;

  • 代理人卢霞

  • 地址 210000 江苏省南京市鼓楼区新模范马路66号

  • 入库时间 2023-06-19 17:14:18

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-10-18

    公开

    发明专利申请公布

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