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基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法

摘要

本发明提供一种基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法,包括如下步骤:1)数据预处理2)构建跨批次相似细胞连通图3)使用生成式对抗网络矫正批次效应。本发明属于生物信息分析技术领域,本发明提供的基于连通图和生成式对抗网络的数据批次效应矫正方法,为两批次、多批次、非重叠和小样本单细胞RNA‑seq数据集存在的批次效应提供了解决方案,它以来自不同批次的基因表达谱矩阵作为输入,并输出矫正后的基因表达谱,经过矫正后的基因表达可以结合每个批次的特征,并按照设定的模式调整每个批次的基因表达,这为研究不同批次细胞基因表达差异提供了新的见解。

著录项

  • 公开/公告号CN114400047A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-04-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国石油大学(华东);

    申请/专利号CN202210048433.9

  • 申请日2022-01-17

  • 分类号G16B30/00;G06N3/04;G06N3/08;

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 266580 山东省青岛市黄岛区长江西路66号

  • 入库时间 2023-06-19 15:03:56

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-04-26

    公开

    发明专利申请公布

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