基于改进生物地理学优化算法的多序列比对方法及系统

摘要

本发明提供了一种基于改进生物地理学优化算法的多序列比对方法及系统，包括：数据采集模块，被配置为：获取原始多序列数据；对比模块，被配置为：依据原始多序列数据，以及预设的隐马尔科夫模型，得到比对结果；其中，所述隐马尔科夫模型中，将每一个栖息地看作是一条隐马尔科夫链，利用改进生物地理学优化算法优化所述隐马尔科夫模型中存在的参数；本发明针对基因多序列比对问题，在HMM模型中，每一个栖息地看作是一条隐马尔科夫链；然后利用改进的算法MPBBO优化HMM模型中存在的参数，不断提高比对的精度；改进的MPBBO算法具有较强的全局探索能力、局部开发能力和收敛速度较快的特点；能获得较为精确的基因序列比对结果。