获自功能型苹果的MsLBD13蛋白及其编码基因和应用

摘要

本发明公开了一种获自功能型苹果的MsLBD13蛋白及其编码基因和应用。本发明提供的MsLBD13蛋白，是如下(a1)或(a2)：(a1)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；(a2)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物花青苷含量相关的由序列1衍生的蛋白质。编码MsLBD13蛋白的基因(命名为MsLBD13基因)也属于本发明的保护范围。本发明还保护MsLBD13蛋白的应用，为如下(b1)或(b2)：(b1)调控植物的花青苷含量；(b2)降低植物的花青苷含量。本发明发现了MsLBD13蛋白及其功能，可用于培育花青苷含量改变的转基因植物，在植物育种中具有重大应用前景。

说明书

技术领域

本发明涉及一种获自功能型苹果的MsLBD13蛋白及其编码基因和应用。

背景技术

“医食同源”是发展方向，“吃营养，吃健康”已经成为人们的共识。苹果耐贮性好，供应周期长，是世界性果品，尤其果实含有较高比例的、人体比较容易吸收的游离多酚，具有很好的抗氧化、抗肿瘤、预防心脑血管疾病及保肝等作用，营养保健价值高，有“一天一苹果，医生远离我”(An apple a day keeps the doctor away！)的美誉，世界上相当多的国家都将其列为主要消费果品而大力推荐。近几年的调研结果表明，一方面，在过去几十年国内外育成的1000多个苹果品种，80％是‘金帅’等品种的杂交、实生或芽选后代，这种“近亲繁殖”往往带来品种的遗传基础狭窄及抗逆性减退等问题；另一方面，特色、多抗和多样性果品成为产业发展的重要方向。

新疆野苹果及其红肉变型(Malus sieversii f.neidzwetzkyana)是世界栽培苹果的祖先种，不仅遗传多样性极为丰富，而且富含类黄酮等功能、保健成分，是进行抗逆与品质育种的珍贵基因库。但因农田开垦等原因，新疆野苹果的遗传多样性正遭到严重破坏，濒临灭绝；我国是世界上最大的苹果生产和消费国，其中2012年生产苹果3950万吨，主要用于鲜食，且近70％是类黄酮含量较低的富士品种。

因此，围绕“新疆野苹果资源的科学保护与持续高效利用、栽培品种遗传基础拓展、苹果产业转型升级与共给侧结构改革和农民持续增收以及人类健康水平提升”，进行联合攻关与集成示范，本发明的发明人与美国康奈尔大学的教授合作，对新疆野苹果及欧洲森林苹果等世界范围内的97份苹果资源进行了基因组重测序与生物信息学分析，构建了新疆红肉苹果与苹果品种杂种一代及回交一、二代分离群体，研究明确了新疆野苹果群体遗传结构与遗传多样性特征、核心种质构建的技术参数、类黄酮含量等性状的遗传变异特点及发育机理，提出了“功能型苹果”的概念及“宽行高干、行间生草、给草施肥、肥田养根”的现代果园管理理念，创建了常规杂交与生物技术有机结合的苹果高效育种技术体系，创制了一批新品种及优异种质，研发了苹果新品种配套高效栽培技术体系。目前，已授权和申报发明专利10余项，定植杂种实生苗4万余株，育成新品种(系)16个；发表相关研究论文120篇，其中SCI论文20余篇，这些研究成果总体处在国际同类研究的领先水平。

发明内容

本发明的目的是提供一种获自功能型苹果的MsLBD13蛋白及其编码基因和应用。

本发明提供了一种蛋白质，获自苹果，命名为MsLBD13蛋白，是如下(a1)或(a2)：

(a1)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；

(a2)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物花青苷含量相关的由序列1衍生的蛋白质。

为了使(a1)中的MsLBD13蛋白便于纯化和检测，可在由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质的氨基末端或羧基末端连接上如表1所示的标签。

表1标签的序列

标签残基序列Poly-Arg5-6(通常为5个)RRRRRPoly-His2-10(通常为6个)HHHHHHFLAG8DYKDDDDKStrep-tag II8WSHPQFEKc-myc10EQKLISEEDL

上述(a2)中的MsLBD13蛋白可人工合成，也可先合成其编码基因，再进行生物表达得到。上述(a2)中的MsLBD13蛋白的编码基因可通过将序列表中序列2所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子，和/或进行一个或几个碱基对的错义突变，和/或在其5′端和/或3′端连上表1所示的标签的编码序列得到。

编码MsLBD13蛋白的基因(命名为MsLBD13基因)也属于本发明的保护范围。

MsLBD13基因为如下(1)或(2)或(3)：

(1)编码区序列表中序列2所示的DNA分子；

(2)在严格条件下与(1)限定的DNA序列杂交且编码与植物花青苷含量相关的蛋白质的DNA分子；

(3)与(1)限定的DNA序列具有90％以上同源性且编码与植物花青苷含量相关的蛋白质的DNA分子。

上述严格条件可为用0.1×SSPE(或0.1×SSC)，0.1％SDS的溶液，在DNA或者RNA杂交实验中65℃下杂交并洗膜。

含有MsLBD13基因的重组表达载体、表达盒、转基因细胞系、转基因植物组织或重组菌均属于本发明的保护范围。

可用现有的植物表达载体构建含有MsLBD13基因的重组表达载体。所述植物表达载体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。使用MsLBD13基因构建重组表达载体时，可在其转录起始核苷酸前加上任何一种增强型、组成型、组织特异型或诱导型启动子，它们可单独使用或与其它的植物启动子结合使用；此外，使用MsLBD13基因构建重组表达载体时，还可使用增强子，包括翻译增强子或转录增强子，这些增强子区域可以是ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等，但必需与编码序列的阅读框相同，以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的，可以是天然的，也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选，可对所用植物表达载体进行加工，如加入在植物中表达可产生颜色变化的酶或发光化合物的基因、具有抗性的抗生素标记物或是抗化学试剂标记基因等。从转基因植物的安全性考虑，可不加任何选择性标记基因，直接以表型筛选转化植株。所述重组表达载体的出发载体可为pRI101载体。所述重组表达载体具体可为在pRI101载体的NdeI和BamHI酶切位点之间插入序列表的序列2所示的双链DNA分子得到的重组质粒。

所述植物组织具体可为植物愈伤组织，更具体可为植物幼叶愈伤组织。所述植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。

本发明还保护MsLBD13蛋白的应用，为如下(b1)或(b2)：

(b1)调控植物的花青苷含量；

(b2)降低植物的花青苷含量。

所述植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。

本发明还保护MsLBD13基因在培育花青苷含量降低的转基因植物中的应用。所述植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。

本发明还保护一种培育转基因植物的方法，包括如下步骤：将MsLBD13基因导入出发植物，得到花青苷含量低于所述出发植物的转基因植物。所述出发植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。所述MsLBD13基因具体可通过以上任一所述重组表达载体导入所述出发植物。所述方法中，具体可将所述MsLBD13基因导入出发植物的愈伤组织，然后将愈伤组织培育为植株。所述愈伤组织具体可为幼叶愈伤组织。携带有所述MsLBD13基因的重组表达载体可通过Ti质粒、Ri质粒、植物病毒载体、直接DNA转化、显微注射、电导、农杆菌介导等常规生物学方法转化到植物细胞或组织中。

本发明还保护一种培育转基因植物组织的方法，包括如下步骤：将MsLBD13基因导入出发植物组织，得到花青苷含量低于所述出发植物组织的转基因植物组织。所述出发植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。所述MsLBD13基因具体可通过以上任一所述重组表达载体导入所述出发植物组织。所述植物组织具体可为植物愈伤组织。所述愈伤组织具体可为幼叶愈伤组织。

本发明还保护一种植物育种方法，包括如下步骤：提高目的植物中MsLBD13蛋白的含量和/或活性，从而降低目的植物中花青苷的含量。所述出发植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。

本发明还保护MsLBD13蛋白或MsLBD13基因或以上任一所述方法，在植物育种中的应用。所述植物育种的目的为培育花青苷含量降低的植物。所述植物可为单子叶植物或双子叶植物。所述双子叶植物具体可为蔷薇科植物。所述蔷薇科植物具体可为苹果属植物。所述苹果属植物具体可为苹果，更具体可为苹果‘紫红1号’。

本发明发现了MsLBD13蛋白及其功能，可用于培育花青苷含量改变的转基因植物，在植物育种中具有重大应用前景。

附图说明

图1为表型鉴定的结果。

具体实施方式

以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。

pRI101载体(又称“pRI101-AN DNA”)：Takala公司，Code No.3262。农杆菌LBA4404：Tiangen公司，产品目录号：CC2901。苹果‘紫红1号’(又称‘紫红1号’红肉苹果)：参考文献：《‘紫红1号’红肉苹果果肉抗氧化性及花色苷分析》。

1％盐酸甲醇溶液：97.2ml甲醇与2.8ml浓盐酸混合。浓盐酸即市售12mol/L盐酸。

KCl缓冲液(pH＝1、0.025M)：1.86g KCl用980ml蒸馏水溶解，用浓盐酸调pH为1.0，转移到1L容量瓶中，用蒸馏水定容。

NaAC缓冲液(pH＝4.5、0.4M)：54.43g NaAC用960ml蒸馏水溶解，用浓盐酸调pH为4.5，转移到1L容量瓶中，用蒸馏水定容。

制备幼叶愈伤组织的方法具体参见文献：Ji X H,Zhang R,Wang N,Yang L&Chen X S.Transcriptome profiling reveals auxin suppressed anthocyanin biosynthesis in red-fleshed apple callus(Malus sieversii f.niedzwetzkyana).Plant Cell Tiss Organ Cult,2015,123:389–404.。

实施例1、MsLBD13蛋白及其编码基因的发现

从‘紫红1号’苹果愈伤组织中发现了一个新蛋白，如序列表的序列1所示，将其命名为MsLBD13蛋白。将编码MsLBD13蛋白的基因命名为MsLBD13基因，其开放阅读框如序列表的序列2所示。

将序列表的序列3所示的蛋白质命名为对照蛋白(GENBANK ACCESSION NO.XP_008340959.1)。将对照蛋白的编码基因命名为对照基因，如序列表的序列4所示。

实施例2、MsLBD13蛋白的功能鉴定

一、构建重组质粒

1、构建重组质粒pRI101-MsLBD13

(1)人工合成序列表的序列2所示的双链DNA分子。

(2)以步骤(1)得到的DNA分子为模板，采用F1和R1组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物。

F1：5’-CCCATATGATGAGTTGCAACGGCTGT-3’；

R1：5’-CGGGATCCTCAGGGGAACAAGTTGAGAAGCT-3’。

(3)用限制性内切酶NdeI和BamHI双酶切步骤(2)得到的PCR扩增产物，回收酶切产物。

(4)用限制性内切酶NdeI和BamHI双酶切pRI101载体，回收约10kb的载体骨架。

(5)将步骤(3)的酶切产物与步骤(4)的载体骨架连接，得到重组质粒pRI101-MsLBD13。根据测序结果，对重组质粒pRI101-MsLBD13进行结构描述如下：在pRI101载体的NdeI和BamHI酶切位点之间插入了序列表的序列2所示的双链DNA分子。

2、构建对照质粒

将人工合成的序列表的序列4所示的双链DNA分子插入pRI101载体的NdeI和BamHI酶切位点之间，得到对照质粒。

二、转MsLBD13基因愈伤组织的获得

1、将重组质粒pRI101-MsLBD13导入农杆菌LBA4404，得到重组农杆菌。

2、将步骤1得到的重组农杆菌接种至30ml含50μg/ml卡那霉素和50μg/ml利福平的液体YEP培养基，28℃振荡培养至OD_600nm＝0.6，12000rpm离心收集菌体，用30ml>2O悬浮，加入乙酰丁香酮并使其浓度为100μM，得到侵染液。

3、取苹果‘紫红1号’的幼叶愈伤组织，浸没到步骤2得到的侵染液中，室温振荡30min。

4、完成步骤3后，取愈伤组织，置于含1mg/L 6-BA和0.3mg/L NAA的固体MS培养基上，28℃暗培养2天，然后转移到含1mg/L 6-BA、0.3mg/L NAA、50mg/L卡那霉素和50mg/L利福平的固体MS培养基上培养30天(24℃，16h光照/8h黑暗)。

5、完成步骤4后，取愈伤组织，提取基因组DNA，采用F2和R2组成的引物对进行PCR鉴定，PCR鉴定为阳性的即为转MsLBD13基因愈伤组织。

F2：5’-GACGCACAATCCCACTATCC-3’；

R2：5’-GGGGAACAAGTTGAGAAGCT-3’。

F2对应载体骨架上的35S启动子部分序列，R2对应MsLBD13基因上的部分序列，靶序列长度约为950bp。

6、完成步骤5后，取转MsLBD13基因愈伤组织，置于含1mg/L 6-BA、0.3mg/L NAA、50mg/L卡那霉素和50mg/L利福平的固体MS培养基上继代培养。

三、对照愈伤组织的获得

将对照质粒代替重组质粒pRI101-MsLBD13进行步骤二，得到转对照基因愈伤组织。

将pRI101载体代替重组质粒pRI101-MsLBD13进行步骤二，得到转空载体愈伤组织。

四、表型鉴定

各个愈伤组织的照片见图1。图1中分别为步骤二的6中培养30天后的转MsLBD13基因愈伤组织、步骤三的6中培养30天后的转对照基因愈伤组织、步骤三的6中培养30天后的转空载体愈伤组织和处于同一时期的苹果‘紫红1号’幼叶愈伤组织(用WT表示)。‘紫红1号’苹果的愈伤组织显示为深紫色，花青苷含量较高。转MsLBD13基因愈伤组织颜色发黄，花青苷含量较低。转空载体愈伤组织与‘紫红1号’苹果的愈伤组织的颜色基本一致。转对照基因愈伤组织显示为紫黄相间的颜色，花青苷含量高于转MsLBD13基因愈伤组织且低于‘紫红1号’苹果的愈伤组织。

五、花青苷定量鉴定

待测愈伤组织分别为：24℃培养15天的转MsLBD13基因愈伤组织、24℃培养15天的转对照基因愈伤组织、24℃培养15天的转空载体愈伤组织、24℃培养15天的‘紫红1号’幼叶愈伤组织。愈伤组织的培养均采用含1mg/L 6-BA、0.3mg/L NAA、50mg/L卡那霉素和50mg/L利福平的固体MS培养基。

按照如下步骤进行操作：

准确称取0.5g待测愈伤组织(0.5g待测待测愈伤组织在液氮中研磨成粉末)，加入5ml预冷的1％盐酸甲醇溶液。4℃避光浸提24h。取2份提取液(每份1ml)，1份提取液加入4ml KCl缓冲液(pH＝1.0)混匀静置4℃避光浸提15min，另1份提取液加入NaAc缓冲液(pH＝4.5)混匀静置4℃避光浸提15min。8000r/min离心10min，测定510nm和700nm下的吸光值。花青苷含量(mg/g)＝△A*5*0.005*1000*449.2/(26900*0.5)。

△A＝(A_510nm-A_700nm)(pH＝1.0)-(A_510nm-A_700nm)(pH＝4.5)。

进行五次重复试验，每次重复试验中取10份待测愈伤组织的平均值。

转MsLBD13基因愈伤组织的花青苷类化合物含量为27.658mg/kg。转对照基因愈伤组织的花青苷类化合物含量为38.623mg/kg。转空载体愈伤组织的花青苷类化合物含量为57.883mg/kg。‘紫红1号’幼叶愈伤组织的花青苷类化合物含量为62.784mg/kg。本段中的“kg”指的均为愈伤组织鲜重。

SEQUENCE LISTING

<110> 山东农业大学

<120> 获自功能型苹果的MsLBD13蛋白及其编码基因和应用

<130> GNCYX170830

<160> 4

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 279

<212> PRT

<213> 苹果

<400> 1

Met Ser Cys Asn Gly Cys Arg Val Leu Arg Lys Gly Cys Ser Glu Ser

1 5 1015

Cys Met Leu Arg Pro Cys Leu Gln Trp Ile Glu Thr Pro Glu Ala Gln

202530

Gly His Ala Thr Val Phe Val Ala Lys Phe Phe Gly Arg Ala Gly Leu

354045

Met Ser Phe Ile Ser Ala Val Pro Asp Ser Gln Arg Pro Gly Ser Leu

505560

Phe Phe Arg Leu Tyr Pro Ser Phe Ser Arg Leu Arg Phe Pro Met Phe

65707580

Ser Phe Leu Ile Phe Val Arg Leu Phe Ser Val Leu Phe Gln Ser Leu

859095

Leu Phe Glu Ala Cys Gly Arg Thr Val Asn Pro Val Asn Gly Ala Val

100 105 110

Gly Leu Leu Trp Thr Gly Asn Trp His Val Cys Gln Ala Ala Val Glu

115 120 125

Thr Val Leu Leu Gly Gly Thr Leu Arg Pro Ile Pro Glu Leu Leu Gly

130 135 140

Gly Ala Ser Thr Pro Asp Glu Ala Ser Glu Ala Asp Val Gly Gly Val

145 150 155 160

Ile Asn Cys Thr Asp Met Trp Arg Leu Arg Asp Pro Ser His Asn Ser

165 170 175

Gly Ser Ser Ser Arg Phe Pro Ser Ser Arg Ser Ala Arg Ala Ser Ser

180 185 190

Pro Lys Arg Lys Arg Ser Thr Ala Asp Asp Glu Ser Ser Thr Lys Leu

195 200 205

Leu Gln Leu Gln His His Ala Asp Leu Asp Leu Arg Leu Thr Pro Thr

210 215 220

Met Ser Phe Lys Pro Lys Pro Lys Pro Glu Thr Arg Arg Pro Gly Thr

225 230 235 240

Pro Ser Met Asn Ser Glu Glu Ser Gly Val Thr Thr Cys Phe Glu Ser

245 250 255

Gly Phe Ala Asp His His Arg Ser Ser Tyr Ser Val Gly Pro Glu Arg

260 265 270

Lys Leu Leu Asn Leu Phe Pro

275

<210> 2

<211> 840

<212> DNA

<213> 苹果

<400> 2

atgagttgca acggctgtcg agttctccga aagggctgca gcgagtcatg catgctccgc 60

ccctgcctcc agtggatcga aacccccgaa gcccaaggcc acgccaccgt cttcgtcgcc 120

aagttcttcg gccgcgccgg cctcatgtcc ttcatctccg ccgtccccga ttcccaacga 180

cccggttcgt tatttttccg attataccct tcgttttcac gactccgttt ccccatgttt 240

tcgtttctga tttttgttcg tttgttttca gttctgtttc agtccttgtt gtttgaagcc 300

tgcggccgta cggtcaatcc ggtcaacgga gcggttgggc tgctctggac cggcaactgg 360

cacgtctgcc aggccgccgt cgaaaccgtc ctcctcggcg gcacgctccg gccgattccc 420

gagctcctcg gcggagcgtc cactcccgac gaggcctccg aggccgacgt cggcggcgtc 480

atcaactgta cggacatgtg gaggctccga gatccgagtc acaactccgg ttcctcctcc 540

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<212> PRT

<213> 苹果

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505560

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859095

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100 105 110

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115 120 125

Gly Gly Val Ile Asn Cys Thr Asp Met Trp Arg Leu Arg Asp Pro Ser

130 135 140

His Asn Ser Gly Ser Ser Ser Arg Phe Pro Ser Ser Arg Ser Ala Arg

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<212> DNA

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gtcacaacgt gcttcgagag cggcttcgcg gatcaccatc ggtcctctta ctccgtggga 720

ccggagagaa agcttctcaa cttgttcccc tga753