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一种抗HIV-1药物的筛选方法

摘要

本发明提供了一种抗HIV-1药物的筛选方法,将BST-2的氨基端连接生物发光共振能量转移供体蛋白,Vpu的羧基端连接生物发光共振能量转移受体蛋白,使BST-2和Vpu之间产生生物发光共振能量转移(BRET)信号,进而将两种融合蛋白共表达在细胞中,并建立稳定表达两种融合蛋白的细胞系,添加待检样品至此细胞中,检测细胞BRET信号的变化,若BRET值下降,则待检样品为抗HIV-1阳性药物。利用该方法能够方便、快速地筛选抗HIV-1的药物,为抗HIV-1药物的筛选提供了新途径。

著录项

  • 公开/公告号CN103540644A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2014-01-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国医学科学院病原生物学研究所;

    申请/专利号CN201210239795.2

  • 发明设计人 郭斐;庞晓静;胡斯奇;

    申请日2012-07-10

  • 分类号C12Q1/66;C12Q1/02;C12N15/85;C12N15/66;C12N5/10;

  • 代理机构北京路浩知识产权代理有限公司;

  • 代理人王朋飞

  • 地址 100730 北京市东城区东单三条9号病原生物学研究所

  • 入库时间 2024-02-19 21:31:47

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2015-04-01

    授权

    授权

  • 2014-03-12

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/66 申请日:20120710

    实质审查的生效

  • 2014-01-29

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及生物医药领域,具体涉及一种抗HIV-1药物的筛选方 法。

背景技术

艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)为当前在全 球范围内流行的重大传染病之一,是由人免疫缺陷病毒(human  immunodeficiency virus,HIV)感染导致人体免疫机能缺陷,而易于发生 机会性感染和肿瘤的临床综合征。在过去的20多年里造成2000多 万人死亡,目前全世界艾滋病病毒感染者已达4000万左右,艾滋病 对人类健康,社会稳定造成严重威胁。在艾滋病疫苗尚未研制成功的 现阶段,药物治疗是艾滋病防治的主要手段。目前已经有4类24种 抗逆转录病毒药物应用于艾滋病的抗病毒治疗,包括11种核苷类逆 转录酶抑制剂(NRTI),3种非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI),9种 蛋白酶抑制剂(PI)和1种融合抑制剂(FI)。但病毒的进化使得耐药性不 断产生,这就需要不断寻求针对新靶点的新型抗艾滋病病毒药物。

引起世界范围流行的艾滋病的病原体主要是人类免疫缺陷病毒1 (Human immunodeficiency virus type1,HIV-1),HIV-1的致病机理 及其与宿主因素的相互作用十分复杂。对抗病毒的宿主细胞因子 Tsg101、APOBEC3G等越来越受到关注。因此,了解病毒与宿主的 关系及其相互作用机制是寻找有效的抗病毒药物和治疗策略的新途 径。病毒在进化过程中需要不断的克服宿主细胞的限制作用才能得以 在宿主体内生存,其中HIV-1自身的辅助蛋白Vpu可克服宿主限制 因子BST-2(bone marrow stromal cell antigen2,又称CD317, HM1.24),从而促进病毒从宿主细胞的释放。

BST-2因最近发现能抑制HIV-1的释放而引起了科学界极大的关 注,它能将新生的病毒粒子粘附于病毒感染细胞表面又得名Tetherin。 BST-2是一种拓扑结构较为独特的膜蛋白,含有两个疏水区。该蛋白 质的氨基端位于胞质中,随后是一个约19个氨基酸的跨膜蛋白域 (TM)及胞外卷曲螺旋基序,其羧基端为约17个氨基酸的糖基磷脂 酰肌醇锚定点(GPI anchor)。位于细胞表面的BST-2,其GPI锚定 点位于病毒出芽部位-脂伐中,而跨膜区位于脂伐外,通过胞外的半 胱氨酸残基形成二聚体或多聚体的形式而将出芽的病毒和宿主细胞 连接,使病毒粒子束缚于细胞表面,从而抑制病毒的释放。

如前所述,BST-2的这种抑制病毒释放的作用可被HIV-1的辅助 蛋白Vpu拮抗。Vpu也为跨膜蛋白,具有两个主要的结构域:氨基 端的疏水跨膜域和羧基端的具有两个可磷酸化丝氨酸残基的胞质域。 Vpu可与BST-2共定位,两种蛋白通过各自的跨膜区产生相互作用, 进而通过胞质区的β-TrCP结合位点,将BST-2与细胞内的泛素化通 路相连,以内体-溶酶体途径或蛋白酶体途径降解BST-2,使其在细 胞表面的含量减少,从而促进HIV-1病毒粒子的释放。因此,可将 BST-2与Vpu跨膜区的相互作用作为新的药物靶标,破坏两者相互之 间的联系,抑制Vpu降解BST-2,从而恢复BST-2向细胞表面的运 输而达到病毒释放减少的目的。

BRET(Bioluninescence resonance energy transfer生物发光共振 能量转移)为一种在活细胞内实时监测两种蛋白质相互作用的方法。 此方法将两种目标蛋白各自与生物发光共振能量转移供体蛋白(如 Renilla的荧光素酶,Rluc)和受体蛋白(如EYFP)融合表达,当两种 目标蛋白产生相互作用时,距离会小于10nm,这时加入外源底物(如 Coelenterazine h)而使Rluc产生激发光,此激发光可由一对偶极子介 导向受体蛋白EYFP转移,从而激发EYFP产生发射光,通过仪器可 检测蛋白质发生作用前后的信号变化,是一种研究蛋白质之间相互作 用的良好方法。

目前国内关于艾滋病药物筛选的方法层出不穷,但方法不够简 便,或者作用机制不甚明确,因此,亟待推出新的简单高效,能够实 现高通量并且机制明确的药物筛选方法。

发明内容

针对上述不足,本发明提供一种抗HIV-1药物的筛选方法。

本发明提供的抗HIV-1药物的筛选方法,包括步骤:添加待检样 品至能稳定表达RB和VE的细胞系的细胞中,检测细胞BRET信号 的变化,若BRET信号下降,则待检样品为抗HIV-1阳性药物;所 述RB是将BST-2的氨基端与生物发光共振能量转移供体蛋白连接而 成的,所述VE是将Vpu的羧基端与生物发光共振能量转移受体蛋白 连接而成的,使BST-2和Vpu之间产生BRET信号。

其中,所述生物发光共振能量转移供体蛋白选自:海肾荧光素酶 Rluc。

其中,所述生物发光共振能量转移受体蛋白选自:增强型黄色荧 光蛋白EYFP。

其中,所述细胞系为293细胞系。

本发明提供了一种筛选稳定表达RB和VE的细胞系的方法,是 将双表达RB和VE的质粒转染细胞后,添加终浓度为1mg/ml的抗 生素G418,初筛10-14天,将细胞进行单克隆化操作,扩大培养后, 经观察和检测仪检测,两种蛋白表达均良好的细胞系确定为稳定表达 RB、VE的细胞系。

在本发明的实施例中,使用荧光显微镜观察和luciferase检测仪 进行检测。

其中,所述双表达RB和VE的质粒为pRB-VE,能在细胞内同 时表达RB和VE两种蛋白。

本发明还提供了上述方法筛选得到的稳定表达RB和VE的细胞 系。

本发明提供了一种用于筛选抗HIV-1药物的稳定表达RB和VE 的细胞系。

优选地,用于筛选抗HIV-1药物的稳定表达RB和VE的细胞系 为293细胞系。

本发明提供了一种真核双表达质粒,其为pRB-VE,其核苷酸序 列如SEQ ID NO.11所示。

本发明提供了一种构建上述真核双表达质粒的方法,包括以下步 骤:

1)质粒pRB构建:

a)以phBST-2为模板,以引物

F:AAATATGCGGCCGCCCATGGCTTCCAAGGTGTAC;

R:CTAGTCTAGATTACTGCTCGTTCTTCAG进行PCR扩增,得 到hBST-2片段;

b)以pRluc-N2为模板,以引物

F:CCCAAGCTTCCACCATGGCTTCCAAGGTGTAC,

R:CCGGAATTCCTGCTCGTTCTTCAGCAC进行PCR扩增,得 到Rluc片段;

c)将Rluc基因克隆到真核表达载体pcDNATM3.1/V5-His A中,酶 切位点为HindIII,EcoRI,然后在此载体中克隆进hBST-2基因,酶切 位点为NotI,XbaI,构建得到质粒pRB;

2)质粒pVE的构建:

a)以pVpu为模板,以引物

F:CTAGCTAGCCACCATGGTGCCCATTATTGT,

R:CCCAAGCTTCAGGTCGTCAATGTCCCA进行PCR扩增,得 到Vpu片段;

b)将Vpu基因克隆进载体pEYFP-N1中,酶切位点NheI,HindIII, 构建质粒pVE;

3)质粒pRB-VE的构建:

a)以质粒pRB为模板,以引物

F:CGCGGATCCCCACCATGGCTTCCaAGGTGTAC,

R:AGCTTTGTTTAAACTCACTGCAGCAGAGCGCT进行PCR 扩增得到RB片段,

b)以质粒pVE为模板,以引物

F:CGGGGTACCCCACCATGGTGCCCATTATTGTC,

R:CCCAAGCTTTTACTTGTACAGCTCGTC进行PCR扩增得到 VE片段;

c)将RB,VE分别克隆进载体pYr-adshuttle-3中,RB克隆位点为 MCSI:BamHI,PmeI,VE克隆位点为MCSII:KpnI,HindIII,构建质粒 pRB-VE。

本发明提供了上述方法在筛选抗HIV-1药物中的应用。

本发明提供了真核表达质粒pRB和pVE或真核表达质粒 pRB-VE在筛选抗HIV-1药物中的应用。

本发明提供了293细胞系在筛选抗HIV-1药物中的应用。

本发明运用生物发光共振能量转移(Bioluminescence resonance  energy transfer1,BRET)技术,以人类宿主细胞因子BST-2和HIV-1 病毒辅助蛋白Vpu之间的相互作用为药物靶点,应用BRET方法, 针对双表达BST-2和Vpu的稳定表达细胞系,筛选出破坏两种蛋白 质相互作用的小分子化合物,建立了细胞水平的抗HIV-1药物筛选模 型。进而提供了一种筛选抗HIV-1药物的方法。在此方法中,将待测 化合物直接加入到此稳定表达蛋白的细胞中,观察BRET信号较对照 组(只加溶剂DMSO)是否降低,如若降低,说明两种蛋白间的相互 作用受到了化合物的抑制,可作为初筛阳性结果。本发明中的药物筛 选方法操作简单,避免了每次实验前转染细胞的繁琐程序,只需加药 -再培养-测定几个简单的步骤,有效地实现快速、高通量。利用该方 法能够方便、快速地筛选抗HIV-1药物,为HIV-1的治疗药物的筛选 提供了新途径。

附图说明

图1是质粒pRB的图谱。

图2是质粒pVE的图谱。

图3是质粒pRB-VE图谱。

图4是稳定表达细胞株中RB和VE蛋白表达western检测图。

具体实施方式

以下实施例进一步说明本发明的内容,但不应理解为对本发明的 限制。在不背离本发明精神和实质的情况下,对本发明方法、步骤或 条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。

若未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟 知的常规手段。

实施例1

1、构建表达载体

以phBST-2(购自NIH AIDS Reagent Program)为模板,以引物 F:AAATATGCGGCCGCCCATGGCTTCCAAGGTGTAC, R:CTAGTCTAGATTACTGCTCGTTCTTCAG扩增,得到hBST-2片 段。

以pRluc-N2(购自PerkinElmer公司)为模板,以引物 F:CCCAAGCTTCCACCATGGCTTCCAAGGTGTAC, R:CCGGAATTCCTGCTCGTTCTTCAGCAC扩增,得到Rluc片段,

以pVpu(购自NIH AIDS Reagent Program)为模板,以引物 F:CTAGCTAGCCACCATGGTGCCCATTATTGT, R:CCCAAGCTTCAGGTCGTCAATGTCCCA扩增,得到Vpu片段。

将Rluc基因(酶切位点为HindIII,EcoRI)克隆到真核表达载体 pcDNATM3.1/V5-His A(购自Invitrogen公司)中,继而在此载体中克 隆进人源的BST-2基因(酶切位点为NotI,XbaI),构建质粒pRB; 将HIV-1的辅助蛋白Vpu克隆进载体pEYFP-N1(购自Clontech公 司)中,酶切位点为NheI,HindIII,构建质粒pVE。

PCR反应体系:

补加去离子水至20μl。PCR参数:94℃预变性5min后,再以94℃ 变性30sec、54℃退火30sec、72℃延伸30sec的条件进行30次循环, 最后72℃延伸10min,4℃持续。

2、细胞培养

取293细胞进行培养,待细胞在T75培养瓶中长成致密单层,已 基本上饱和后,吸除培养瓶内旧培养液,5毫升PBS洗一遍,以去除 残余的血清,向瓶内加入0.25%胰蛋白酶3毫升,覆满瓶底,室温消 化90秒,当发现细胞质回缩,细胞间隙增大后,吸除胰蛋白酶,向 瓶内注入完全培养基(含10%胎牛血清,100U/ml青霉素,100μg/ml 链霉素的DMEM),轻轻反复吹打,使之从瓶壁脱离形成细胞悬液, 并将细胞团打散成单细胞,部分用来传至新T75中继续于37℃、 5%CO2培养箱中培养,部分用于铺六孔板(每孔3×105个细胞)待转 染质粒。

3、细胞转染

铺细胞后16-20h,将细胞更换无血清无抗生素的新鲜的 1×DMEM,置37℃,5%CO2培养箱培养1-2h。质粒pRB和pVE(或 单独pRB)各2μg混入300μl1×DMEM中,轻轻混匀成质粒混合液, 室温放置5min;取PEI2μl,加入300μl1×DMEM中,轻轻混匀成PEI 混合液,室温放置5min。将上述质粒混合液与PEI混合液轻轻混匀 成转染混合液,室温放置20-25min;将六孔板中培养液吸出,将上述 转染混合液轻轻加入,轻晃,置37℃,5%CO2培养箱培养。4-6h后 吸出转染液,换成完全培养基(含10%胎牛血清,100U/ml青霉素, 100μg/ml链霉素的DMEM),继续培养24-48h。

4、生物发光共振能量转移(BRET)测定:

转染后的细胞PBS清洗一遍,以PBS吹散,调整细胞数为1×106个/ml,分至底部和周围均不透光的96孔白板(Costar)中,毎孔90μl, 海肾荧光素酶底物Coelenterazine h(50μmol/L,Promega公司)10μl, (终浓度5μmol/L),立即上机(Pekin Elmer reader)测定475nm和 530nm两处发射光强度。

以公式530nm发射光强度/475nm发射光强度(同时表达RB和 VE)-530nm发射光强度/475nm发射光强度(只表达RB)计算BRET 比值。结果显示,转染的细胞中产生了较强的BRET信号,说明将单 独表达RB的质粒pRB和单独表达VE的质粒pVE共同转染宿主细 胞,能够实现同时表达RB和VE,并在RB和VE之间产生了生物发 光共振能量转移。

实施例2

1、构建双表达载体

以质粒pRB为模板, 以F:CGCGGATCCCCACCATGGCTTCCaAGGTGTAC, R:AGCTTTGTTTAAACTCACTGCAGCAGAGCGCT为引物扩增RB 片段,

以质粒pVE为模板,

以F:CGGGGTACCCCACCATGGTGCCCATTATTGTC,R: CCCAAGCTTTTACTTGTACAGCTCGTC为引物扩增VE片段,将 RB,VE分别克隆进载体pYr-adshuttle-3(购自湖南赢润生物公司)中, 克隆位点分别为RB(MCSI:BamHI,PmeI),VE(MCSII:KpnI,HindIII), 构建质粒pRB-VE。

PCR反应体系:

补加去离子水至20μl。PCR参数:94℃预变性5min后,再以94℃ 变性30sec、54℃退火30sec、72℃延伸1min的条件进行30次循环, 最后72℃延伸10min,4℃持续。

2、细胞培养

取293细胞进行培养,待细胞在T75培养瓶中长成致密单层,已 基本上饱和后,吸除培养瓶内旧培养液,5毫升PBS洗一遍,以去除 残余的血清,向瓶内加入0.25%胰蛋白酶3毫升,覆满瓶底,室温消 化90秒,当发现细胞质回缩,细胞间隙增大后,吸除胰蛋白酶,向 瓶内注入完全培养基(含10%胎牛血清,100U/ml青霉素,100μg/ml 链霉素的DMEM),轻轻反复吹打,使之从瓶壁脱离形成细胞悬液, 并将细胞团打散成单细胞,部分用来传至新T75中继续于37℃、 5%CO2培养箱中培养,部分用于铺六孔板(每孔3×105个细胞)待转 染质粒。

3、细胞转染

铺细胞后16-20h,将细胞更换无血清无抗生素的新鲜的 1×DMEM,置37℃,5%CO2培养箱培养1-2h。质粒pRB-VE(或pRB) 2μg,混入300μl1×DMEM中,轻轻混匀成质粒混合液,室温放置 5min;取PEI2μl,加入300μl1×DMEM中,轻轻混匀成PEI混合液, 室温放置5min。将上述质粒混合液与PEI混合液轻轻混匀成转染混 合液,室温放置20-25min;将六孔板中培养液吸出,将上述转染混合 液轻轻加入,轻晃,置37℃,5%CO2培养箱培养。4-6h后吸出转染 液,换成完全培养基(含10%胎牛血清,100U/ml青霉素,100μg/ml 链霉素的DMEM),继续培养24-48h。

4、筛选稳定表达细胞系

将铺有293细胞的24孔板加入不同浓度的G418(购自Merke公 司),确定最佳筛选浓度为1mg/ml。将双表达质粒pRB-VE在六孔 板中转染293细胞,转染后24小时将细胞传至T75培养瓶中,加入 G418(浓度为1mg/ml)筛选稳定表达RB-VE的细胞系,初筛10-14 天左右,将细胞分至96孔板(每孔1-2个细胞)进行单克隆化操作, 将长成细胞团的孔在荧光显微镜下观察,若有荧光则继续扩大培养, 并通过luciferase检测仪检测RB的表达,并进一步通过Western  Blotting验证两种蛋白的表达情况(图4)。两种蛋白表达均良好的 确定为筛选成功的细胞系。

5、样品制备

化合物样品:DMSO稀释纯品化合物到2mmol/L,取1μl作用于 100μl细胞体系,使其终浓度为20μmol/L。

阳性对照短肽BST-2-TM样品:

干粉状态BST-2跨膜区模拟短肽(BST-2-TM)(购自中国医学 科学院医药生物技术研究所)以双蒸水溶解至500μmol/L,取10μl 加至100μl细胞体系,使其终浓度为50μmol/L。此短肽模拟BST-2 跨膜区结构合成,同BST-2一样,也可与Vpu的跨膜区相互作用, 从而与RB竞争和VE的作用,减少了RB到VE之间的能量转移, 从而降低BRET信号。

6、加药筛选与生物发光共振能量转移(BRET)测定

将步骤4中建系成功的细胞扩大培养后,调整细胞数为5×105个 /ml,分至周围白色不透明,底部为平底透明的96孔细胞培养板 (Costar)中,毎孔100μl,同时将化合物样品加入到细胞液中,毎 孔1μl,使其终浓度为20μmol/L,阴性对照组加溶剂DMSO做对照, 阳性对照组加BST-2-TM做对照,置37℃,5%CO2培养箱中继续培 养24小时。而后吸去96孔板中的培养基,每孔加入100μL PBS洗1 遍,再加入PBS90μl,海肾荧光素酶底物Coelenterazine h(50μmol/L, Promega公司)10μl,至终浓度为5μmol/L立即上机(Pekin Elmer  reader)测定475nm和530nm两处发射光强度。

以公式530nm发射光强度/475nm发射光强度(同时表达RB和 VE)-530nm发射光强度/475nm发射光强度(只表达RB)计算BRET 比值。

结果:阳性对照组BRET比值明显低于阴性溶剂对照组,表明 BST-2-TM明显抑制了BST-2和Vpu之间的相互作用。从组合化学库 中共筛选12000个样品,其中初筛阳性化合物27个,阳性率为 0.225%。经过本系统筛选出的初筛阳性结果BRET比值显示大大降 低,说明本发明提供的抗HIV-1药物的筛选方法具备可行性。

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