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一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法

摘要

本发明属于植物基因工程技术领域,公开了一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法,测定转录组数据;TopHat2与参考基因组比对,结合Cufflinks对转录本拼接得转录本;去除表达量和可信度低的单外显子转录本、选择转录本长度>200bp转录本、筛除与数据库注释exon区域有重叠转录本、选择FPKM≥0.5转录本,确定疑似lncRNAs;用PFAM和CPC得lncRNAs。本发明确定在番茄I型腺体毛高表达的lncRNA,得调控番茄腺毛形成的lncRNA000100,全长序列为1266bp;该基因在番茄中超量表达,显著抑制I型番茄腺毛形成;可以在番茄抗虫、抗病毒、抗逆境等方面进行应用。

著录项

  • 公开/公告号CN109112124A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-01-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华中农业大学;

    申请/专利号CN201811126376.1

  • 申请日2018-09-26

  • 分类号C12N15/11(20060101);C12N15/10(20060101);C12N15/82(20060101);A01H5/00(20180101);A01H6/82(20180101);

  • 代理机构11401 北京金智普华知识产权代理有限公司;

  • 代理人杨采良

  • 地址 430070 湖北省武汉市狮子山街1号

  • 入库时间 2024-02-19 06:43:01

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-01-25

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N15/11 申请日:20180926

    实质审查的生效

  • 2019-01-01

    公开

    公开

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