二次元HPLCの開発と人髄液プロテオームへの応用

摘要

二次元ゲル電気泳動法を用いない手法によるプロテオミックスとして，二次元HPLC法の高分離能とエレクトロスプレーィオン化質量分析法の高感度，高選択性および，タンデム質量分析法とデータベース検索から得られるシーケンス情報を兼ね備えたオンラインHPLC-MSシステムが用いられてきている。 本研究では脱塩処理も含めたオンライン自動二次元HPLCシステムを開発し，人髄液プロテオームへの臨床応用を試みた。 開発したシステムは，ミクロスケールからナノスケールへのダウンサイジングにより，高感度を実現するナノエレクトロスプレー質量分析法へも対応可能とした。本自動分析システムおよび，分子量カットフィルタ等による簡便な前処理法を併用して，人髄液より主要なたんばく質を含む100種類程度の，たんばく質を同定した。 これらの結果より，臨床プロテオーム等へ本システムが十分適応可能であることを示した。