リボソームタンパク質をバイオマーカーとしたMALDI-TOF MSによる細菌識別－S10-GERMS法による細菌の迅速識別

摘要

これまでのリボソームタンパク質をバイオマーカーとした微生物同定法は，系統解析をする上で次のような課題が存在した；1）基準株（Type strain）のゲノム解読情報が必要である；2）ゲノム解読されたリボソームタンパク質データベースにエラーが存在する；3）種レベルの系統学的距離を示すことが困難である。そこで，細菌に共通に存在するS10-spc-alphaオペロンにコードされるリボソームタンパク質をバイオマーカーとしたMALDI-TOF MS（Matrix-Assisted Laser Desorption／Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry）による細菌同定·識別法（S10-spc-alpha operon Gene Encoded Ribosomalprotein Mass Spectrum：S10-GEKMS法）を確立した。本S10-GERMS法に使用するS10-spc-alphaオペロンは，約半数のリボソームタンパク質と数種のハウスキーピング遺伝子をコードするため，本オペロンの配列決定とMAIDI-TOF MS測定により，データベース構築，校正および最適なリボソームタンパク質の選択が可能になり，種および株レベルの迅速·簡便な系統解析が可能であることを初めて示した。