RNAシーケンスから抽出された造血器腫瘍99細胞株の融合転写産物の解析

摘要

キメラ形成は腫瘍化の重要なメカニズムである。造血器腫 瘍細胞株の公共データからコンピュータにて計1,284個の融 合転写産物を抽出し,集計と病的意義の検討を行った。切断 点間距離が1M base pair未満のキメラが同番号染色体由来 のものの76%を占めた。形成機構の最多は“欠失”で,“均衡 型転座”は4.6%であった。染色体長と出力キメラ数に相関 を認めたが13番と19番は例外であった。In-frameのキメラ, long noncoding RNA (IncRNA)を含むキメラは全体の16% ずつで,前者のうち4種(CLECLLKLRB1等)と後者のうち 3 種(PFKFB3-LINC02649, LINC01934-ITGA4, PVT1-CCDC26) が多系統多細胞株にて繰り返し認められた。今後,細胞実験 の検証を通して新たながん関連遺伝子の発見とIncRNAの理 解が進み,治療標的の発見が期待される。