КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ СОВМЕСТНОГО ОТКЛИКА НА ОТБОР ПАТТЕРНОВ МГЭ И ПОЛИГЕННОЙ СИСТЕМЫ

摘要

Исследована компьютерная модель отклика на отбор трех паттернов генома: полигенов, мобильных генетических элементов (МГЭ) и меток идентичности по происхождению (МИП). В каждом поколении отбора разнообразие паттернов каждого типа описывалось деревом (дендрограммой) сходства, построенным методом UPGMA. Учитывался жесткий отсекающий (+)-отбор по аддитивному полигенному признаку, а также рекомбинации между сегментами генетической карты, МГЭ делились на три группы: модификаторы (усилители) экспрессии полигенов, маркеры и независимые копии. Показано, что к 30-40-му поколению усиленные активные аллели полигенов фиксированы на 95-96% (утрачены на 2-3%), неусаленные аллели фиксированы на 70-80% (утрачены иа 16-17%). Во всех поколениях средняя гетерозиготность Н_k~n <= max D_k~n - длины максимального маршрута по дереву. К этому же времени МГЭ-модификаторы фиксированы на 85-88% (утрачены на 11-12%), МГЭ-маркеры - на 60-70% (утрачены на 21-25%) и независимые копии -на 30-40% (утрачены на 50-60%). Независимые копии МГЭ в целом подчинялись прогнозу теории генетического дрейфа, МГЭ-модификаторы вели себя почти так же, как модифицируемые ими полигены, а МГЭ-маркеры проявили промежуточные свойства. Паттерны МИП очень быстро гомозиготизировались, особенно резко разнообразие упало между10-м и 30-м поколениями. В F50 финальный паттерн-консенсус полигенов содержит 16 усиленных аллелей полигенов из 18 и 18 неусиленных аллелей из 21. Для МГЭ-модификаторов соотношение "фиксации": "утраты" равно 16 : 3, для МГЭ-маркеров -15 : 6, для независимых копий МГЭ - 25 : 28 при 7 полиморфных. В паттерне-консенсусе МИП из 100 исходных меток осталось 1.3, они образуют 26 фрагментов размером от 1 до 10 сегментов карты; 21 фрагмент содержит активные аллели полигенов, а 14 из них - еще МГЭ-модификаторы. Рекомбинационное перемешивание паттернов не завершено, В ходе отбора активные аллели полигенов "влекут за собой" окружающие сегменты, в том числе - содержащие МГЭ-модификаторы и маркеры. Они образуют консервативную часть всех паттернов-консенсусов, остальные сегменты в них случайны.