ГЕНОМНАЯ КОНСТИТУЦИЯ АВТОТЕТРАПЛОИДНОГО ОВСА Avena macrostachya, ВЫЯВЛЕННАЯ ПУТЕМ СРАВНИТЕЛЬНОГО АНАЛИЗА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ITS1 И ITS2: К ВОПРОС

摘要

Для того чтобы исследовать геномный состав кариотипа Avena macrostachya, секвенировали ITS1, ITS2 и гены 5.8S ядфных рРНК A. macrostachya. трех видов овсов с кариотипом AsAs (A. wiestii, A. hirtula A.atlantica), а также A. longiglumis (А1А1), A. canariensis (AcAc), A. ventricosa (CvCv). A. pilosa и A. clauda (СрСр). Показано, что все исследованные виды рода Avena представляют из себя моно-филетическую группу (бутстрэп-индекс = 98), в составе которой выделяются две ветви - виды с геномами типа А и виды с геномами типа С (бутстрэп-индексы = 100). Объект нашего исследования A. macrostachya сохранил "симметричный" кариотип (т.е. кариотип с метацентрическими хромосомами), характерный, по-видимому, для общего предка Avena, однако относится к филогенетической ветви овсов с геномом С (кариотип с субметацентричными и субакроцентричными хромосомами). мы предлагаем классифицировать геном A. macrostachya как особую форму С-генома - Cm-геном. Среди исследованных видов из других родов наиболее близок к 'Avena по" структуре ITS1 и ITS2 Arrnenatherum elatius. Филогенетические отношения между Avena иHelictotrichon остаются интригующе неясными. Последовательность HPR389153 из генома Н pratense наиболее близка к ITS 1 видов Avena с геномом А (p-расстояние = 0.0237), в то время как различия этой последовательности с по-следователъностъю ITS1 A. macrostachya достигают 0.1221. С другой стороны, последовательностьHAD389117 из генома Н. adsurgens близка к ITS1 видов Avena с геномом С (p-расстояние = 0.0189), различия же ее от ITS1 видов с геномом А достигают 0.1221. Возможно, появление высокополиплоидных (2п - 12х-21д:) видов Н. pratense и Н. adsurgens было связано с межвидовой гибридизацией, в которой принимали участие средиземноморские овсы с геномами А и С. Предложена гипотеза о путях эволюции хромосом Avena на ранних этапах дивергенции видов этого рода.