Проведено исследование разнообразия генов I6S рРНК в микробном сообществе эндемичной губки Lubomirskia baicalensis с обесцвеченными участками тканей. В микробиоме губки выявлено восемь бактериальных филумов: Cyanobacteria (27.3%; п = 36; 2 OTU, operational taxonomic unit), Pro-teobacteria (22.7%; n = 30; 5 OTU), Actinobacteria (16.7%; n = 22; 7OTU), Verrucomicrobia (15.2%; n = 20; 4 OTU), Planctomycetes (9%; n = 12; 3 OTU), Bacteroidetes (4.5%; n = 6; 3 OTU), WS5 (3%; n = 4; 1 OTU), TM7 (1.5%; я = 2; 1 OTU). В сообществе присутствовали основные филумы, типичные для микробиомов пресноводных губок. Однако, в отличие от ранее исследованных бактериальных ассоциаций L. baicalensis, в сообществе обесцвеченной губки отмечены доминирование Cyanobacteria и низкая численность представителей Bacteroidetes и Betaproteobacteria. В микробиоме также обнаружены филотипы, проявляющие высокий процент сходства с бактериями, населяющими субстраты с высоким содержанием органических веществ. Очевидно, процессы обесцвечивания байкальских губок влияют на состав и соотношение основных таксономических групп бактерий, ассоциированных с губкой.
展开▼
