ПРОСТОЙ И ЭФФЕКТИВНЫЙ МЕТОД ОЦЕНКИ РАЗМЕРА ДИМИНУЦИЙ ХРОМАТИНА У ЦИКЛОПОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

摘要

Степень диминуции хроматина (ДХ) у разных видов циклопов может существенно отличаться. Биологическая и эволюционная роль этих различий остается не ясной. Для расширения знаний о распространении и величине ДХ у этой группы животных необходима разработка быстрого и эффективного метода оценки изменений размера генома. В данной работе предложен метод оценки величины ДХ у циклопов с использованием метода ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). Анализ изменений размера генома проводился путем сравнения кривых флуоресценции ПЦР-фрагментов целевых генов у до- и постдиминуционного материала. Метод апробирован на четырех видах циклопов. У Cyclops kolensis ДХ составила 95.3 ± 1.2, у Acanthocyclops vernalis — 94.6 + 0.8%, у С.insignis — 82.3 + 5.2%. Впервые обнаружена ДХ у Megacyclops viridis в размере 91.1 + 2.6%. Достоинства предложенного нами подхода состоят в его быстроте, простотеи невысокой требовательности к количеству исследуемого материала.