ВАЖНОСТЬ НАКОПЛЕНИЯ ДАННЫХ ЭКЗОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ РОССИЙСКИХ БОЛЬНЫХ ПРИ ПОИСКЕ ПРИЧИНЫ НАСЛЕДСТВЕННОГО ЗАБОЛЕВАНИЯ В СЕМЬЕ НА ПРИМЕРЕ АДЕНОМАТОЗНОГО ПОЛИПОЗА

摘要

Исследовали образцы ДНК шести членов одной семьи (три пациента с аденоматозным полипозом толстой кишки, двое здоровых и один человек с невыясненным статусом заболевания) методом полноэкзомного секвенирования. Предварительно у одной пациентки проводилась ДНК-диагностика генов APC/MutYH методом секвенирования по Сэнгеру, при которой терминальных мутаций найдено не было. В результате биоинформатического анализаданных у четырех кровных родственников (трое больных и один человек с неизвестным статусом болезни) была выявлена мутация в гене NSUN7, который ранее не описывался как ассоциированный с развитием аденоматозного полипоза толстой кишки. Однако в дальнейшем выяснилось, что популяционная частота этого варианта в данном гене именно в России существенно выше, чем встречаемость самого заболевания. При повторном био-информатическом анализе только у трех больных выявлена ранее не описанная гетерозиготная делеция, включающая экзоны 2-16 гена АРС, а также участки генов SRP19 и REEP5, которая впоследствии подтверждена методом мультиплексной проба-зависимой лигазной реакции с последующей амплификацией (MLPA, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification). Проведенное молекулярно-генети-ческое исследование продемонстрировало необходимость создания и постоянного пополнения отечественной базы данных вариантами, найденными при высокопроизводительном секвенирова-нии. Также установлена целесообразность выполнения поиска больших делеций в гене АРС у российских пациентов с аденоматозным полипозом толстой кишки.