Изучение механизма репликации вируса классической чумы свиней (CSFV) необходимо для понимания его патогенеза. В данной работе для исследования репликации CSFV использованы представления теории информации и показана их связь со статистической механикой и статистика малых выборок, основанная на приближении Байеса. Кроме того, сформулировано правило отбора сайтов связывания белков, основанное на принципе максимальной энтропии. С помощью этих методов и редукционного алгоритма проанализировано информационное содержание З'-нетранслирующих областей (З'-UTRs) геномов 20 штаммов CSFV и 5'-нетранслирующих областей (5'-UTRs) геномов 58 штаммов CSFV, а также выделены значимые последовательности. Их первичные и вторичные структуры имеют сходство с регулирующими репликацию цмс-элементами, поэтому найденные участки идентифицированы как расположенные в З'-UTRs и 5'-UTRs потенциальные сайты репликации, узнаваемые CSFV-решшказой, причем такая интерпретация до некоторой степени подтверждена рядом экспериментальных данных. На основе информационного анализа выдвинута модель инициации репликации CSFV.
展开▼
