АНАЛИЗ ПУТЕЙ ВЫВОДА МОЛЕКУЛЯРНОГО КИСЛОРОДА ИЗ ФОТОСИСТЕМЫ II ЦИАНОБАКТЕРИЙ: МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

摘要

В тилакоидах цианобактерий, а также других фотосинтезирующих организмов образование молекулярного кислорода с использованием энергии света осуществляет огромный липид-пигмент-белковый комплекс, называемый фотосистемой II (ФСII). Кислородвыделяющий комплекс расположен в глубине люменальной части ФСII, и молекулам диоксида, чтобы освободить активный центр фермента, необходимо преодолеть белковое окружение. Предыдущие исследования по выявлению кислородных каналов в ФСII основывались либо на анализе полостей внутри ее статической структуры, либо на экспериментах по внедрению молекул благородных газов в кристаллы ФСII под давлением. Это позволило определить некоторые возможные пути выхода молекул, а также статические положения молекулярного кислорода. В работе описано моделирование движения кислорода в транспортной системе ФСII методом молекулярной динамики.