Axiom 200K SNPジエノタイピングアレイを用いたダイズミニコアコレクションの農業 関連形質のゲノムワイド関連解析

摘要

農業生物資源ジーンバンクから配布されているダイズミニコアコレクション（Kaga et al. 2012)は、様々な農業特性の評価に利用される ようになつてきた力、ユーザーからはゲノム ワイド関連解析（GWAS)に使える遺伝子型 データなど、付加的な情報配信に開する要望 が多い。最近、NGSを用いたジエノタイピン グ方法が主流になりつつある力、Affymetrix Axiom genotyping technology (Hoffmann et al. 2011)は、従来のマイクロアレイによるシステ ムよりも遥かに安価なプラットフオームとし て浸透しつつある。そこで本研究では、遺伝 子型デ一タの充実によるミニコアコレクショ ンの高度化を目的に、AxiomSNPジエノタイ ビングアレイによるジエノタイピングと新た な遺伝子型データによるGWASを試行した。