Молекулярно-генетическая характеристика шига-токсинпродуцирующих Escherichia coli,выделенных при вспышке пищевой инфекции в Санкт-Петербурге в 2013 году

摘要

Пищевые инфекции, вызываемые шига-токсинпродуцирующими штаммами Escherichia coli (STEC), регистрируются во многих странах мира и представляют серьезную проблему для общественного здравоохранения. Сведений об эпидемиологии, этиологической структуре STEC-инфекций и молекулярно-генетических особенностях STEC-патогенов в Российской Федерации крайне недостаточно. Цель исследования: изучить вспышку пищевой инфекции в форме геморрагического колита (ГК) с гемолитико-уремическим синдромом (ГУС), энтероколита и острого гастроэнтерита среди детей Санкт-Петербурга в 2013 г. Методы: в работе использованы эпидемиологические, микробиологические, молекулярно-генетические и биоинформационные методы анализа. Результаты: объектами исследования послужили образцы клинического материала, пробы молока и пищевых продуктов, а также штаммы STEC, выделенные во время вспышки пищевой инфекции. Установлено, что вспышка пищевой инфекции была вызвана потреблением сырого молока, обсемененного STEC, что подтверждено данными эпидемиологического анализа, выявлением в пробах молока ДНК STEC и выделением возбудителей из испражнений больных детей и из проб молока. Данные полногеномного секвенирования показали, что описываемая вспышка была вызвана двумя группами патогенов: Е. coli O157.H7 и Е. coli О101.НЗЗ. Штаммы первой группы отнесены к ранее известному сиквенс-типу - ST24, второй группы - к ранее не описанному ST145, зарегистрированному нами в базе данных shigatox.net. В геномах штаммов обеих групп присутствуют нуклеотидные последовательности УТ2-подобных профагов с интегрированными в них генами stx2c и нуклеотидные последовательности плазмид с генами энтерогемолизинов, а также гены синтеза основного фактора адгезии ЕНЕС интимина: в группе Е. coli O157:H7 - интимина гамма, а в группе Е. coli O101.H33 - интимина йота 2, до настоящей работы обнаруженного только в группе энтеропатогенных эшерихий (ЕРЕС). Заключение: пополнение знаний по эпидемиологии и биологии возбудителей STEC-инфекций позволит усовершенствовать диагностику, лечение и профилактику геморрагического колита.