Přehled molekulárně biologických metod používaných při studiu mikrobiálního osídlení čistírenských kalů a jiných environmentálních vzorků

摘要

Microbial community is greatly affected by local environmental conditions. Traditional cultivation techniques used for microorganism identification are gradually replaced with molecular biological methods which yield greater specificity. According to published research, molecular methods have led to the discovery of numerous previously undetectable organisms. In terms of biological wastewa-ter treatment, these methods have yielded a better understanding of reactor conditions and microorganism population which in turn enables greater process control and optimization. This paper summarizes the most common molecular biology techniques used in wastewater treatment and environmental sampling.%Biocenóza vzorků aktivovaných kalů a přírodních ekosystémů je silně ovlivněna prostředím, v němž mikroorganismy žijí. Kultivační techniky dříve využívané k identifikaci jsou již dnes nahrazovány molekulárně biologickými metodami. Tyto metody umožňují dokázat přítomnost mikroorganismů s vysokou specificitou - až na úroveň druhu. S rozšířením těchto technik se dokazuje, že v aktivovaném kalu v mnoha případech dominují mikroorganismy, které dříve používanými postupy nebylo možné detekovat. Hlubší pochopení souvislostí mezi podmínkami v nádrži a přítomným biologickým osídlením je důležité pro optimalizaci systému, což může vést k zvýšení účinnosti aplikované biotechnologie. V textu bude shrnuto několik nejčastějších metod molekulární biologie, používaných na identifikaci mikroorganismů aktivovaných kalů z čistíren odpadních vod a jiných environmentálních vzorků.