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Full Sequence Ahead

机译:提前完整序列

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摘要

Some of the most abundant microorganisms in surface ocean communities are resistant to cultivation in the laboratory. Metagenome sequencing can reveal insights into the metabolism and physiology of such microbes, but the other ~200 fully sequenced marine microbial genomes to date remain poor references for useful comparisons. To provide a better genomic context for uncultivated microbes, Dupont et al. used metagenomic reconstructions of Global Ocean Survey samples to generate two nearly complete genomes of SAR86 bacteria, a clade of ubiquitous nonphotosynthetic y-proteobacteria. The authors also sequenced two partial genomes of single cells within the SAR86 lineage collected off the coast of San Diego, USA. The reconstructed genomes and single-cell genomes all suggest that SAR86 bacteria have streamlined metabolisms: They cannot synthesize all of their required vitamins or amino acids and rely on specialized carbon sources.
机译:表层海洋群落中一些最丰富的微生物对实验室的培养有抵抗力。元基因组测序可以揭示这种微生物的代谢和生理学见解,但迄今为止,其他约200个完全测序的海洋微生物基因组仍缺乏有用的比较依据。为了为未培养的微生物提供更好的基因组背景,Dupont等人。运用全球海洋调查样本的宏基因组学重建技术,生成了两个几乎完整的SAR86细菌基因组,这是一个普遍存在的非光合作用y变形杆菌。作者还对在美国圣地亚哥海岸附近收集的SAR86谱系中单个细胞的两个部分基因组进行了测序。重建的基因组和单细胞基因组均表明SAR86细菌具有简化的新陈代谢:它们无法合成所有必需的维生素或氨基酸,并且无法依靠专门的碳源。

著录项

  • 来源
    《Science》 |2012年第6067期|p.382|共1页
  • 作者

  • 作者单位
  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

  • 入库时间 2022-08-18 02:53:19

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