Review of procaryote metabolism in view of modeling microbial adaptation from fast growth to starvation conditions

摘要

More than 50 years ago, Monod (1949) proposed the application of the Michaelis-Menten relation describing enzyme kinetics to a culture of microorganisms. For the purpose of simplification, the mathematical relation proposed by Monod (1949) reduced the entire cell to a single enzyme genetically expressed in a single intensity. However, cell metabolism is based on a large number of biochemical reactions. This paper reviews the literature to identify the controlling factors of cell metabolism and the regulation of specific activity of the cell. The literature review was designed to highlight which regulation mechanisms induce a growth-rate variation so that they can be expressed mathematically. The study of these processes will focus on modeling the specific activity variation. The review is limited to heterotrophic procaryote organisms under aerobic conditions.%Il y a plus de 50 ans, Monod (1949) a proposé d'appliquer l'équation de Michaelis-Menten décrivant la cinétique de l'enzyme à une culture de microorganismes. À des fins de simplification, la relation mathématique proposée par Monod (1949) réduit la cellule entière en un seul enzyme génétiquement exprimé à une seule intensité. Toutefois, le métabolisme de la cellule est basé sur un grand nombre de réactions biochimiques. Le présent article revoit la littérature afin d'identifier les facteurs contrôlant le métabolisme de la cellule et la régulation de l'activité spécifique de la cellule. La revue de la littérature a été conçue pour souligner les mécanismes de régulation qui induisent une variation du taux de croissance afin de les exprimer mathématiquement. L'étude de ces procédés portera sur la modélisation de la variation de l'activité spécifique. La revue est limitée aux organismes procaryotes hétérotrophes sous des conditions aérobies.